RNA–Protein interactions for RNA: YMR172W

HOT1, Transcript of Transcription factor for glycerol biosynthetic genes, yeast

Gene HOT1, Length 2,160 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOT1	YMR172W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	KEX1	P09620	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	NIP100	P33420	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	TFC3	P34111	1160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	RGD1	P38339	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	CAT8	P39113	1433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	POL1	P13382	1468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	DRS2	P39524	1355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	ECM4	P36156	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SRL3	P36167	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	YTA6	P40328	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	VID28	P40547	921 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	FAR11	P53917	953 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	MET7	Q08645	548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SEN2	P16658	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	GAL11	P19659	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	HSP78	P33416	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	YJR008W	P47085	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	BET4	Q00618	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	CMP2	P14747	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
HOT1	YMR172W	ACP1	P32463	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	DLD1	P32891	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SEG2	P34250	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	MRP8	P35719	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	NUP60	P39705	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	MAM1	P40065	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SYG1	P40528	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	IOC3	P43596	787 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	PMT7	Q06644	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	RAV1	P47104	1357 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HOT1	YMR172W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	MRPL40	P36534	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	BFA1	P47113	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SGM1	P47166	707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	CWH41	P53008	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	YKU80	Q04437	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	FAR8	Q05040	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	COG4	Q06096	861 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	YIG1	Q08956	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	ATG9	Q12142	997 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	TUP1	P16649	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SAK1	P38990	1142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	ATG3	P40344	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	LAM5	P43560	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	DMA2	P53924	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	MFM1	Q02783	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	MGR3	Q04472	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	NNT1	Q05874	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	APC11	Q12157	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	HIR3	P47171	1648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	PET122	P10355	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	RPC34	P32910	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	BLI1	P35727	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	DID4	P36108	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	HXT5	P38695	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	NPA3	P47122	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	YNL058C	P53947	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SFB2	P53953	876 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SEC5	P89102	971 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	CTF4	Q01454	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	SRC1	Q03707	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	TAF8	Q03750	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	KOG1	P38873	1557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HOT1	YMR172W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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