RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W OPI1P21957 404 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SSA4P22202 642 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W CLB5P30283 435 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W PFF1P38244 976 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W ORC6P38826 435 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W BDH2P39713 417 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SLX8P40072 274 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W HST1P53685 503 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W KIN4Q01919 800 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SRC1Q03707 834 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W BDF2Q07442 638 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W DPH6Q12429 685 aa7.3□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W CIC1P38779 376 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W ATG32P40458 529 aa7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W HAP5Q02516 242 aa7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W HRQ1Q05549 1077 aa7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W THI3Q07471 609 aa7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W MGM1P32266 881 aa7.28□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SOL3P38858 249 aa7.28□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W PEX14P53112 341 aa7.28□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W ARP5P53946 755 aa7.28□□□□□ -1.24
LCB3YJL134W SIS2P36024 562 aa7.27□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W TTI1P36097 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SQS1P53866 767 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W YBL036CP38197 257 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W HAL5P38970 855 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W NUG1P40010 520 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W CTF18P49956 741 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SAS4Q04003 481 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W IRC3Q06683 689 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W TAH18Q12181 623 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W LAM4P38800 1345 aa7.26□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PEP3P27801 918 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W IMP2'P32351 346 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PRX1P34227 261 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data7.25□□□□□ -1.25not detected
LCB3YJL134W MET1P36150 593 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W ICP55P40051 511 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W VID28P40547 921 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W HYR1P40581 163 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W IRC8P47046 822 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W YKE2P52553 114 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PMD1P32634 1753 aa7.25□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W FIG2P25653 1609 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RGR1P19263 1082 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RRP8P38961 392 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RVS167P39743 482 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W YIR042CP40586 236 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W CIR1P42940 261 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RPT4P53549 437 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W ERO1Q03103 563 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W INM2Q05533 292 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PEX19Q07418 342 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PSK2Q08217 1101 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W AIM44Q99299 758 aa7.24□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W MATALPHA2P0CY08 210 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W HMLALPHA2P0CY09 210 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W FRD1P32614 470 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W YHL017WP38745 532 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SHC1P39000 512 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RSM25P40496 264 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W ENT3P47160 408 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W KAR5Q04746 504 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W ELG1Q12050 791 aa7.23□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W RPN12P32496 274 aa7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W FBP26P32604 452 aa7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W UBX2Q04228 584 aa7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LCB3YJL134W CYB2P00175 591 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W CAF20P12962 161 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W SIT4P20604 311 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W NPL4P33755 580 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W BOI1P38041 980 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W GRX7P38068 203 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W SPL2P38839 148 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data7.21□□□□□ -1.26not detected
LCB3YJL134W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W BUD6P41697 788 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W IOC3P43596 787 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W HST2P53686 357 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W IRC4Q03036 179 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W PPM2Q08282 695 aa7.21□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W AI4P03878 556 aa7.2□□□□□ -1.26
LCB3YJL134W MPH3P0CE00 602 aa7.2□□□□□ -1.26
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