RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C STS1P38637 319 aa6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C YER130CP39959 443 aa6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C MTC5Q03897 1148 aa6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C COG4Q06096 861 aa6.07□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C URB1P34241 1764 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C STE11P23561 717 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C GSY2P27472 705 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C FBP26P32604 452 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RFC5P38251 354 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C SAP30P38429 201 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C SLX8P40072 274 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C CTH1P47976 325 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C FAR11P53917 953 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C YLR407WQ06070 228 aa6.06□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C OSM1P21375 501 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C DEP1P31385 405 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C GEF1P37020 779 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C BUD6P41697 788 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C ECM23Q02710 187 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C YCG1Q06680 1035 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C SSP2Q08646 371 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C GYP5Q12344 894 aa6.05□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C VID28P40547 921 aa6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C PIB2P53191 635 aa6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RNT1Q02555 471 aa6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RMT2Q03305 412 aa6.04□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C PEP3P27801 918 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C CIC1P38779 376 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C WAR1Q03631 944 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C GIN4Q12263 1142 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C CLB1P24868 471 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C MSH1P25846 959 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C ENT3P47160 408 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C VPS75P53853 264 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C MRS2Q01926 470 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C VPS64Q03944 604 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C PSH1Q12161 406 aa6.03□□□□□ -1.44
SSZ1YHR064C RSF2P46974 1380 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C MPH3P0CE00 602 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C CBP3P21560 335 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PKC1P24583 1151 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C KIC1P38692 1080 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C THI12P42883 340 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C THI5P43534 340 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C CSN12P47130 423 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C THI11P47183 340 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C MAL13P53338 473 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C ALF1P53904 254 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C THI13Q07748 340 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C YPR204WQ08995 1032 aa6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C CLB5P30283 435 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C YEL043WP32618 956 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data6.01□□□□□ -1.45not detected
SSZ1YHR064C UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C NOC2P39744 710 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C VHR2P40041 505 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C FYV10P40492 516 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C YJL007CP47080 104 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C YBP2P53169 641 aa6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C DPB3P27344 201 aa6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C DAN4P47179 1161 aa6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SML1Q04964 104 aa6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C YKL068W-AQ3E826 78 aa6□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SEC18P18759 758 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PHO13P19881 312 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PXL1P36166 706 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C RTT107P38850 1070 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.99□□□□□ -1.45not detected
SSZ1YHR064C CAJ1P39101 391 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C BIM1P40013 344 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C MVP1P40959 511 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C HXT10P43581 546 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C STR2P47164 639 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C ATG13Q06628 738 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PHM7Q12252 991 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C PET123P17558 318 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C IMP2'P32351 346 aa5.99□□□□□ -1.45
SSZ1YHR064C APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms