RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W SMY1P32364 656 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W KAR9P32526 644 aa5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W NUP120P35729 1037 aa5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W OSH3P38713 996 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W FTR1P40088 404 aa5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TAP42Q04372 366 aa5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa5.68□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W SEN2P16658 377 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W MET4P32389 672 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PET112P33893 541 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W MET1P36150 593 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W MEF2P39677 819 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RNH70P53331 553 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YOL057WQ08225 711 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W IRC20Q06554 1556 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TAF2P23255 1407 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TSR4P25040 408 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RFC1P38630 861 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PPX1P38698 397 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W CEP3P40969 608 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PEX21P50091 288 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W HOP2P53187 214 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W ARV1Q06541 321 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YIG1Q08956 461 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W IOC2Q12072 812 aa5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TSC11P40061 1430 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W SWC3P31376 625 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W VPS35P34110 944 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YER034WP40022 185 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W STU2P46675 888 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RTF1P53064 558 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W ORM1P53224 222 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W VTI1Q04338 217 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W COG4Q06096 861 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TCB1Q12466 1186 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W RPO31P04051 1460 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W MER1P16523 270 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PKC1P24583 1151 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W CDC10P25342 322 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TPD3P31383 635 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TTI1P36097 1038 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W HOT1Q03213 719 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W ENT2Q05785 613 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W NNT1Q05874 261 aa5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PET123P17558 318 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W APN1P22936 367 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W MRPL25P23369 157 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W SEC66P33754 206 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W HSM3P38348 480 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W AOS1Q06624 347 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W GNT1Q12096 491 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W PDR18P53756 1333 aa5.65□□□□□ -1.5
CYK3YDL117W LEU1P07264 779 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W NAT1P12945 854 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W UBP14P38237 781 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W APD1P38281 316 aa5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PXA1P41909 870 aa5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RRN11Q04712 507 aa5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YOR352WQ08816 343 aa5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YBL111CQ3E7Y5 667 aa5.65□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ALG2P43636 503 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W DCP2P53550 970 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W OTU2P38747 307 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W IRR1P40541 1150 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W NNF1P47149 201 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SRB7P47822 140 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W LSG1P53145 640 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ASI1P54074 624 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YRM1Q12340 786 aa5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MRPL40P36534 297 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ATG3P40344 310 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SDA1P53313 767 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W BUD7Q08754 746 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SIT4P20604 311 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SAS3P34218 831 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RTT105P40063 208 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TMN3P40071 706 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W IML2P47031 731 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YML108WQ03759 105 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ECM11Q04110 302 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TLG2Q08144 397 aa5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1306.1 ms