RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3c2aQ61194 1686 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kank1E9Q238 1360 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Erbb3Q61526 1339 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim28Q62318 834 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf335A2A5K6 1337 aa25.97■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa25.95■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tsen2Q6P7W5 460 aa25.94■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 NgefQ8CHT1 710 aa25.94■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sox12Q04890 314 aa25.93■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Astn2Q80Z10 1352 aa25.91■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Birc3O08863 600 aa25.91■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Calr4Q3TQS0 420 aa25.91■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ubr1O70481 1757 aa25.91■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col16a1Q8BLX7 1580 aa25.89■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa25.89■■□□□ 1.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mdc1Q5PSV9 1707 aa25.89■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc12a5Q91V14 1138 aa25.88■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map2P20357 1828 aa25.88■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hoxb7P09024 217 aa25.86■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col18a1P39061 1774 aa25.85■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa25.85■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa25.85■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Apaf1O88879 1249 aa25.84■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 CemipQ8BI06 1361 aa25.84■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scn7aB1AYL1 1681 aa25.84■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp1r15aP17564 657 aa25.84■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ap3b2Q9JME5 1082 aa25.84■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttc41Q692V3 1318 aa25.83■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc30Q8BVF4 654 aa25.82■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Neurod2Q62414 383 aa25.82■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem2Q5FWI3 1383 aa25.81■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Camta1A2A891 1682 aa25.81■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ralbp1Q62172 648 aa25.8■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf541Q0GGX2 1363 aa25.79■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spef2Q8C9J3 1734 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slain2Q8CI08 581 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc35g1Q8BY79 368 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rapgef3Q8VCC8 918 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 PalmQ9Z0P4 383 aa25.78■■□□□ 1.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rsph6aQ8CDR2 708 aa25.75■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wnk3Q80XP9 1757 aa25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nlgn1Q99K10 843 aa25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atxn3Q9CVD2 355 aa25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam135bQ9DAI6 1403 aa25.74■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm38655A0A286YDK6 273 aa25.73■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gas2l2Q5SSG4 860 aa25.73■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dennd6aQ8BH65 605 aa25.73■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plekhh1Q80TI1 1356 aa25.72■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprvP70289 1705 aa25.72■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q4VA45 678 aa25.72■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fchsd2Q3USJ8 740 aa25.71■■□□□ 1.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 FancaQ9JL70 1439 aa25.7■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa25.7■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa25.7■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Evi5lH3BKQ3 813 aa25.69■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dusp27Q148W8 1138 aa25.69■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pip4k2bQ80XI4 416 aa25.69■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif4a2P10630 407 aa25.68■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 CenpbP27790 599 aa25.68■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Parp14Q2EMV9 1817 aa25.68■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa25.67■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa25.66■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cavin4A2AMM0 362 aa25.65■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Amigo3Q8C2S7 508 aa25.65■■□□□ 1.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr17E9Q271 1322 aa25.63■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ecm2Q5FW85 670 aa25.62■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cabp4Q8VHC5 271 aa25.62■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Robo1O89026 1612 aa25.62■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mcm10Q0VBD2 885 aa25.61■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ciz1Q8VEH2 845 aa25.61■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 PaskQ8CEE6 1383 aa25.6■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa25.6■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp7bQ64446 1462 aa25.59■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kcna6Q61923 529 aa25.59■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nfat5Q9WV30 1534 aa25.58■■□□□ 1.69
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fyb1O35601 819 aa25.57■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ano8Q6PB70 1060 aa25.57■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 MpripP97434 1024 aa25.57■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncoa4Q5U4H9 625 aa25.57■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Siglec1Q62230 1695 aa25.56■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kcnh8P59111 1102 aa25.55■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 TimelessQ9R1X4 1197 aa25.55■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Farp2Q91VS8 1065 aa25.55■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rwdd1Q9CQK7 243 aa25.54■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Swt1Q9DBQ9 907 aa25.54■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gli3Q61602 1583 aa25.53■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slit2Q9R1B9 1521 aa25.52■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hoxc9P09633 260 aa25.52■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ptpn23Q6PB44 1692 aa25.52■■□□□ 1.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 GnpatP98192 678 aa25.51■■□□□ 1.67
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atf3Q60765 181 aa25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.9 ms