Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,7■■■■■ 5,39
Atxn3Q9CVD2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,86■■■■■ 4,77
Atxn3Q9CVD2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,4■■■■■ 4,7
Atxn3Q9CVD2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,15■■■■■ 4,66
Atxn3Q9CVD2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
Atxn3Q9CVD2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42,92■■■■■ 4,46
Atxn3Q9CVD2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Atxn3Q9CVD2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,16■■■■■ 4,34
Atxn3Q9CVD2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,1■■■■■ 4,33
Atxn3Q9CVD2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Atxn3Q9CVD2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,22
Atxn3Q9CVD2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
Atxn3Q9CVD2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Atxn3Q9CVD2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Atxn3Q9CVD2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,63■■■■■ 4,09
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Atxn3Q9CVD2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Atxn3Q9CVD2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Atxn3Q9CVD2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Atxn3Q9CVD2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Atxn3Q9CVD2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Atxn3Q9CVD2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Atxn3Q9CVD2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Atxn3Q9CVD2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Atxn3Q9CVD2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Atxn3Q9CVD2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,8■■■■□ 3,96
Atxn3Q9CVD2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Atxn3Q9CVD2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Atxn3Q9CVD2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Atxn3Q9CVD2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Atxn3Q9CVD2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Atxn3Q9CVD2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,21■■■■□ 3,87
Atxn3Q9CVD2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Atxn3Q9CVD2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Atxn3Q9CVD2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,96■■■■□ 3,83
Atxn3Q9CVD2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Atxn3Q9CVD2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Atxn3Q9CVD2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Atxn3Q9CVD2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Atxn3Q9CVD2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Atxn3Q9CVD2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Atxn3Q9CVD2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Atxn3Q9CVD2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Atxn3Q9CVD2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Atxn3Q9CVD2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,36■■■■□ 3,73
Atxn3Q9CVD2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Atxn3Q9CVD2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Atxn3Q9CVD2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Atxn3Q9CVD2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Atxn3Q9CVD2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Atxn3Q9CVD2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Atxn3Q9CVD2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Atxn3Q9CVD2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Atxn3Q9CVD2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,84■■■■□ 3,65
Atxn3Q9CVD2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Atxn3Q9CVD2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Atxn3Q9CVD2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Atxn3Q9CVD2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Atxn3Q9CVD2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Atxn3Q9CVD2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Atxn3Q9CVD2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Atxn3Q9CVD2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Atxn3Q9CVD2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Atxn3Q9CVD2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Atxn3Q9CVD2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Atxn3Q9CVD2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,43■■■■□ 3,58
Atxn3Q9CVD2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Atxn3Q9CVD2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37,29■■■■□ 3,56
Atxn3Q9CVD2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Atxn3Q9CVD2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Atxn3Q9CVD2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,27■■■■□ 3,56
Atxn3Q9CVD2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Atxn3Q9CVD2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Atxn3Q9CVD2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Atxn3Q9CVD2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Atxn3Q9CVD2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Atxn3Q9CVD2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Atxn3Q9CVD2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Atxn3Q9CVD2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Atxn3Q9CVD2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Atxn3Q9CVD2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Atxn3Q9CVD2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Atxn3Q9CVD2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Atxn3Q9CVD2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Atxn3Q9CVD2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Atxn3Q9CVD2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
Atxn3Q9CVD2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Atxn3Q9CVD2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Atxn3Q9CVD2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Atxn3Q9CVD2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Atxn3Q9CVD2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Atxn3Q9CVD2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Atxn3Q9CVD2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Atxn3Q9CVD2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Atxn3Q9CVD2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Atxn3Q9CVD2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Atxn3Q9CVD2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Atxn3Q9CVD2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Atxn3Q9CVD2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms