Protein–RNA interactions for Protein: Q62172

Ralbp1, RalA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ralbp1Q62172 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
Ralbp1Q62172 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ralbp1Q62172 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ralbp1Q62172 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ralbp1Q62172 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ralbp1Q62172 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Ralbp1Q62172 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Ralbp1Q62172 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Ralbp1Q62172 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ralbp1Q62172 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Ralbp1Q62172 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Ralbp1Q62172 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ralbp1Q62172 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Ralbp1Q62172 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Ralbp1Q62172 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ralbp1Q62172 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ralbp1Q62172 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Ralbp1Q62172 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ralbp1Q62172 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ralbp1Q62172 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ralbp1Q62172 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ralbp1Q62172 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ralbp1Q62172 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Ralbp1Q62172 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ralbp1Q62172 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ralbp1Q62172 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ralbp1Q62172 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Ralbp1Q62172 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ralbp1Q62172 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ralbp1Q62172 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ralbp1Q62172 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ralbp1Q62172 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ralbp1Q62172 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ralbp1Q62172 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ralbp1Q62172 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Ralbp1Q62172 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ralbp1Q62172 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ralbp1Q62172 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ralbp1Q62172 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ralbp1Q62172 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ralbp1Q62172 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ralbp1Q62172 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ralbp1Q62172 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ralbp1Q62172 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ralbp1Q62172 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ralbp1Q62172 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ralbp1Q62172 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Ralbp1Q62172 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ralbp1Q62172 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ralbp1Q62172 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ralbp1Q62172 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ralbp1Q62172 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ralbp1Q62172 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ralbp1Q62172 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ralbp1Q62172 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ralbp1Q62172 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ralbp1Q62172 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ralbp1Q62172 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ralbp1Q62172 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ralbp1Q62172 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ralbp1Q62172 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ralbp1Q62172 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ralbp1Q62172 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Ralbp1Q62172 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ralbp1Q62172 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ralbp1Q62172 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Ralbp1Q62172 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ralbp1Q62172 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ralbp1Q62172 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ralbp1Q62172 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ralbp1Q62172 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Ralbp1Q62172 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ralbp1Q62172 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ralbp1Q62172 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ralbp1Q62172 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ralbp1Q62172 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ralbp1Q62172 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ralbp1Q62172 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ralbp1Q62172 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ralbp1Q62172 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ralbp1Q62172 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ralbp1Q62172 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ralbp1Q62172 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ralbp1Q62172 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ralbp1Q62172 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ralbp1Q62172 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ralbp1Q62172 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ralbp1Q62172 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ralbp1Q62172 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ralbp1Q62172 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ralbp1Q62172 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ralbp1Q62172 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ralbp1Q62172 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ralbp1Q62172 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Ralbp1Q62172 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ralbp1Q62172 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ralbp1Q62172 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ralbp1Q62172 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ralbp1Q62172 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ralbp1Q62172 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms