Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,82■■■■■ 5,89
Erbb3Q61526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,31■■■■■ 5,32
Erbb3Q61526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,4■■■■■ 5,18
Erbb3Q61526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,32■■■■■ 4,85
Erbb3Q61526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,06■■■■■ 4,8
Erbb3Q61526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,47■■■■■ 4,71
Erbb3Q61526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
Erbb3Q61526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,56■■■■■ 4,56
Erbb3Q61526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Erbb3Q61526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
Erbb3Q61526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,45■■■■■ 4,55
Erbb3Q61526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,39■■■■■ 4,54
Erbb3Q61526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Erbb3Q61526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,08■■■■■ 4,49
Erbb3Q61526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,56■■■■■ 4,4
Erbb3Q61526 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Erbb3Q61526 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,11■■■■■ 4,33
Erbb3Q61526 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,11■■■■■ 4,33
Erbb3Q61526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,1■■■■■ 4,33
Erbb3Q61526 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Erbb3Q61526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Erbb3Q61526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Erbb3Q61526 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Erbb3Q61526 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,19■■■■■ 4,19
Erbb3Q61526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Erbb3Q61526 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Erbb3Q61526 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Erbb3Q61526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Erbb3Q61526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Erbb3Q61526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Erbb3Q61526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Erbb3Q61526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Erbb3Q61526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Erbb3Q61526 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,22■■■■■ 4,03
Erbb3Q61526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Erbb3Q61526 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Erbb3Q61526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
Erbb3Q61526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Erbb3Q61526 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,97■■■■□ 3,99
Erbb3Q61526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Erbb3Q61526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Erbb3Q61526 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,71■■■■□ 3,95
Erbb3Q61526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Erbb3Q61526 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,63■■■■□ 3,93
Erbb3Q61526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Erbb3Q61526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
Erbb3Q61526 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,57■■■■□ 3,92
Erbb3Q61526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Erbb3Q61526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Erbb3Q61526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Erbb3Q61526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Erbb3Q61526 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
Erbb3Q61526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Erbb3Q61526 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,13■■■■□ 3,85
Erbb3Q61526 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Erbb3Q61526 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Erbb3Q61526 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Erbb3Q61526 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,05■■■■□ 3,84
Erbb3Q61526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Erbb3Q61526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Erbb3Q61526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Erbb3Q61526 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Erbb3Q61526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Erbb3Q61526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Erbb3Q61526 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Erbb3Q61526 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Erbb3Q61526 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Erbb3Q61526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Erbb3Q61526 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,62■■■■□ 3,77
Erbb3Q61526 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Erbb3Q61526 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,59■■■■□ 3,77
Erbb3Q61526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Erbb3Q61526 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Erbb3Q61526 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Erbb3Q61526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,73
Erbb3Q61526 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Erbb3Q61526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Erbb3Q61526 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Erbb3Q61526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Erbb3Q61526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Erbb3Q61526 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Erbb3Q61526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,09■■■■□ 3,69
Erbb3Q61526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Erbb3Q61526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Erbb3Q61526 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Erbb3Q61526 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Erbb3Q61526 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Erbb3Q61526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Erbb3Q61526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Erbb3Q61526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Erbb3Q61526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Erbb3Q61526 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Erbb3Q61526 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Erbb3Q61526 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Erbb3Q61526 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Erbb3Q61526 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Erbb3Q61526 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,51■■■■□ 3,6
Erbb3Q61526 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Erbb3Q61526 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Erbb3Q61526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms