Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
Erbb3Q61526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Erbb3Q61526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Erbb3Q61526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
Erbb3Q61526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Erbb3Q61526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
Erbb3Q61526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Erbb3Q61526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Erbb3Q61526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Erbb3Q61526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Erbb3Q61526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Erbb3Q61526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Erbb3Q61526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Erbb3Q61526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Erbb3Q61526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Erbb3Q61526 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Erbb3Q61526 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Erbb3Q61526 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Erbb3Q61526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Erbb3Q61526 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Erbb3Q61526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Erbb3Q61526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Erbb3Q61526 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Erbb3Q61526 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
Erbb3Q61526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Erbb3Q61526 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Erbb3Q61526 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Erbb3Q61526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Erbb3Q61526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Erbb3Q61526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Erbb3Q61526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Erbb3Q61526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Erbb3Q61526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Erbb3Q61526 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Erbb3Q61526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Erbb3Q61526 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Erbb3Q61526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Erbb3Q61526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Erbb3Q61526 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Erbb3Q61526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Erbb3Q61526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Erbb3Q61526 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
Erbb3Q61526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Erbb3Q61526 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Erbb3Q61526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Erbb3Q61526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Erbb3Q61526 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Erbb3Q61526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Erbb3Q61526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Erbb3Q61526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Erbb3Q61526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Erbb3Q61526 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Erbb3Q61526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Erbb3Q61526 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Erbb3Q61526 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Erbb3Q61526 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Erbb3Q61526 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Erbb3Q61526 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Erbb3Q61526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Erbb3Q61526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Erbb3Q61526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Erbb3Q61526 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Erbb3Q61526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Erbb3Q61526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Erbb3Q61526 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Erbb3Q61526 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Erbb3Q61526 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Erbb3Q61526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Erbb3Q61526 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Erbb3Q61526 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Erbb3Q61526 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Erbb3Q61526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Erbb3Q61526 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Erbb3Q61526 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Erbb3Q61526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Erbb3Q61526 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Erbb3Q61526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Erbb3Q61526 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Erbb3Q61526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Erbb3Q61526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Erbb3Q61526 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Erbb3Q61526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Erbb3Q61526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Erbb3Q61526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Erbb3Q61526 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Erbb3Q61526 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Erbb3Q61526 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Erbb3Q61526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Erbb3Q61526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Erbb3Q61526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Erbb3Q61526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Erbb3Q61526 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Erbb3Q61526 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Erbb3Q61526 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Erbb3Q61526 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Erbb3Q61526 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Erbb3Q61526 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Erbb3Q61526 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Erbb3Q61526 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Erbb3Q61526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms