RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pik3c2aQ61194 1686 aa29.16■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.15■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29.15■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col16a1Q8BLX7 1580 aa29.14■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tsen2Q6P7W5 460 aa29.14■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 L3mbtl2P59178 703 aa29.13■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 CemipQ8BI06 1361 aa29.12■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Csrnp3P59055 597 aa29.12■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf541Q0GGX2 1363 aa29.11■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam135bQ9DAI6 1403 aa29.1■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ap3b2Q9JME5 1082 aa29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttc41Q692V3 1318 aa29.09■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sox12Q04890 314 aa29.08■■■□□ 2.25
Opn3-201ENSMUST00000027809 Birc3O08863 600 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp1r15aP17564 657 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 NgefQ8CHT1 710 aa29.07■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem2Q5FWI3 1383 aa29.06■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa29.06■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scn7aB1AYL1 1681 aa29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ubr1O70481 1757 aa29.05■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Erbb3Q61526 1339 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ralbp1Q62172 648 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col18a1P39061 1774 aa29.04■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Calr4Q3TQS0 420 aa29.02■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc12a5Q91V14 1138 aa29.02■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Camta1A2A891 1682 aa29.01■■■□□ 2.24
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa29.01■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rapgef3Q8VCC8 918 aa29■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa29■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.98■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slain2Q8CI08 581 aa28.96■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.96■■■□□ 2.23
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wnk3Q80XP9 1757 aa28.95■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.95■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Apaf1O88879 1249 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 PalmQ9Z0P4 383 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Spef2Q8C9J3 1734 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Map2P20357 1828 aa28.93■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dennd6aQ8BH65 605 aa28.92■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.91■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Neurod2Q62414 383 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nlgn1Q99K10 843 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.9■■■□□ 2.22
Opn3-201ENSMUST00000027809 FancaQ9JL70 1439 aa28.88■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc35g1Q8BY79 368 aa28.87■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 PaskQ8CEE6 1383 aa28.87■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wdr17E9Q271 1322 aa28.86■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 PtprvP70289 1705 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cavin4A2AMM0 362 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Evi5lH3BKQ3 813 aa28.85■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q4VA45 678 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rad17Q6NXW6 688 aa28.84■■■□□ 2.21
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif4a2P10630 407 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dusp27Q148W8 1138 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kcna6Q61923 529 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pip4k2bQ80XI4 416 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.82■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Robo1O89026 1612 aa28.81■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ano8Q6PB70 1060 aa28.81■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atp7bQ64446 1462 aa28.8■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.8■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncoa4Q5U4H9 625 aa28.79■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nfat5Q9WV30 1534 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fyb1O35601 819 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cabp4Q8VHC5 271 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 TimelessQ9R1X4 1197 aa28.77■■■□□ 2.2
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gimap6Q8K349 305 aa28.76■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slit2Q9R1B9 1521 aa28.76■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Aplp2Q06335 707 aa28.75■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Farp2Q91VS8 1065 aa28.75■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cyb5rlB1AS42 316 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp777B9EKF4 885 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atf3Q60765 181 aa28.73■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Siglec1Q62230 1695 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ptpn23Q6PB44 1692 aa28.72■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Amigo3Q8C2S7 508 aa28.71■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gli3Q61602 1583 aa28.71■■■□□ 2.19
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.7■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hoxc9P09633 260 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 DccP70211 1447 aa28.68■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 MpripP97434 1024 aa28.67■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Parp14Q2EMV9 1817 aa28.66■■■□□ 2.18
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 114.3 ms