RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Synj2Q9D2G5 1434 aa33.6■■■□□ 2.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif13aQ9EQW7 1749 aa33.59■■■□□ 2.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa33.59■■■□□ 2.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ecm2Q5FW85 670 aa33.57■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca14E9Q8F8 1683 aa33.57■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naip7Q9JIB3 1402 aa33.55■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AampJ3QN89 436 aa33.53■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cavin4A2AMM0 362 aa33.52■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc12a5Q91V14 1138 aa33.52■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NktrP30415 1453 aa33.51■■■□□ 2.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CastP51125 788 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mre11Q61216 706 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DaxxO35613 739 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Asxl2Q8BZ32 1370 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FanciQ8K368 1330 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cluap1Q8R3P7 413 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PalmQ9Z0P4 383 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd50F7BE84 1390 aa33.45■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc60Q8C4J0 545 aa33.45■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ciz1Q8VEH2 845 aa33.45■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhg1F6S200 1446 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmc1Q8R4P5 757 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf330Q922H9 316 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k19E9Q3S4 1311 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pnmal2G3X9N3 661 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q4VA45 678 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsph4aQ8BYM7 716 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ArxO35085 564 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf316Q6PGE4 1016 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Birc3O08863 600 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim28Q62318 834 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PaskQ8CEE6 1383 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Swt1Q9DBQ9 907 aa33.37■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atl3Q91YH5 541 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fchsd2Q3USJ8 740 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PplQ9R269 1755 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AU019823E9PUQ3 292 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf541Q0GGX2 1363 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nwd1A6H603 1563 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NpatQ8BMA5 1420 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6268A2A3U9 297 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nutm1Q8BHP2 1126 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp32F8VPZ3 1604 aa33.31■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pik3r4Q8VD65 1358 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nectin2P32507 530 aa33.28■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4933416C03RikQ3V063 378 aa33.28■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psme1P97371 249 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r15aP17564 657 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmco5bQ80X59 307 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp7bQ64446 1462 aa33.25■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Txndc2Q6P902 515 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RictorQ6QI06 1708 aa33.2■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa33.2■■■□□ 2.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcm10Q0VBD2 885 aa33.19■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dip2aQ8BWT5 1523 aa33.19■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sptbn5F6UCX4 1208 aa33.18■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hs1bp3Q3TC93 395 aa33.17■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Idi2Q8BFZ6 227 aa33.17■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nsd3Q6P2L6 1439 aa33.17■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IghaA0A0A6YXW6 389 aa33.16■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vamp4O70480 141 aa33.16■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q3UPC7 1272 aa33.15■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cabp2Q9JLK4 216 aa33.15■■■□□ 2.9
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rabep1O35551 862 aa33.14■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plin1Q8CGN5 517 aa33.14■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsph6aQ8CDR2 708 aa33.13■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa33.12■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif18aQ91WD7 886 aa33.12■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SkilQ60665 675 aa33.11■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gnai1B2RSH2 354 aa33.1■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gnai3Q9DC51 354 aa33.1■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map7O88735 730 aa33.1■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtpruB1AUH1 1446 aa33.09■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif1aP33173 1695 aa33.08■■■□□ 2.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp16Q99LG0 825 aa33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.7 ms