Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,59■■■■■ 4,73
Hs1bp3Q3TC93 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Hs1bp3Q3TC93 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Hs1bp3Q3TC93 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,75■■■■■ 4,27
Hs1bp3Q3TC93 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Hs1bp3Q3TC93 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Hs1bp3Q3TC93 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,28■■■■■ 4,04
Hs1bp3Q3TC93 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Hs1bp3Q3TC93 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,9■■■■□ 3,98
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Hs1bp3Q3TC93 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,23■■■■□ 3,87
Hs1bp3Q3TC93 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Hs1bp3Q3TC93 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Hs1bp3Q3TC93 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Hs1bp3Q3TC93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Hs1bp3Q3TC93 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Hs1bp3Q3TC93 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Hs1bp3Q3TC93 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Hs1bp3Q3TC93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Hs1bp3Q3TC93 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Hs1bp3Q3TC93 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,27■■■■□ 3,72
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Hs1bp3Q3TC93 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Hs1bp3Q3TC93 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,98■■■■□ 3,67
Hs1bp3Q3TC93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Hs1bp3Q3TC93 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Hs1bp3Q3TC93 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Hs1bp3Q3TC93 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Hs1bp3Q3TC93 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Hs1bp3Q3TC93 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Hs1bp3Q3TC93 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Hs1bp3Q3TC93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Hs1bp3Q3TC93 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
Hs1bp3Q3TC93 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Hs1bp3Q3TC93 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Hs1bp3Q3TC93 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Hs1bp3Q3TC93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Hs1bp3Q3TC93 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Hs1bp3Q3TC93 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Hs1bp3Q3TC93 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Hs1bp3Q3TC93 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Hs1bp3Q3TC93 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Hs1bp3Q3TC93 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,82■■■■□ 3,48
Hs1bp3Q3TC93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Hs1bp3Q3TC93 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Hs1bp3Q3TC93 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Hs1bp3Q3TC93 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Hs1bp3Q3TC93 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,57■■■■□ 3,44
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Hs1bp3Q3TC93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Hs1bp3Q3TC93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Hs1bp3Q3TC93 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Hs1bp3Q3TC93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Hs1bp3Q3TC93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Hs1bp3Q3TC93 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Hs1bp3Q3TC93 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Hs1bp3Q3TC93 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Hs1bp3Q3TC93 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Hs1bp3Q3TC93 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Hs1bp3Q3TC93 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Hs1bp3Q3TC93 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Hs1bp3Q3TC93 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Hs1bp3Q3TC93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Hs1bp3Q3TC93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Hs1bp3Q3TC93 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Hs1bp3Q3TC93 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Hs1bp3Q3TC93 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Hs1bp3Q3TC93 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Hs1bp3Q3TC93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Hs1bp3Q3TC93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Hs1bp3Q3TC93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Hs1bp3Q3TC93 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Hs1bp3Q3TC93 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Hs1bp3Q3TC93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Hs1bp3Q3TC93 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Hs1bp3Q3TC93 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Hs1bp3Q3TC93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Hs1bp3Q3TC93 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Hs1bp3Q3TC93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Hs1bp3Q3TC93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Hs1bp3Q3TC93 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Hs1bp3Q3TC93 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Hs1bp3Q3TC93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Hs1bp3Q3TC93 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Hs1bp3Q3TC93 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Hs1bp3Q3TC93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Hs1bp3Q3TC93 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Hs1bp3Q3TC93 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Hs1bp3Q3TC93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Hs1bp3Q3TC93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Hs1bp3Q3TC93 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Hs1bp3Q3TC93 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Hs1bp3Q3TC93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Hs1bp3Q3TC93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Hs1bp3Q3TC93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Hs1bp3Q3TC93 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Hs1bp3Q3TC93 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms