Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ30

Ppp1r18, Phostensin, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r18Q8BQ30 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62,95■■■■■ 7,67
Ppp1r18Q8BQ30 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58,84■■■■■ 7,01
Ppp1r18Q8BQ30 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,84■■■■■ 6,85
Ppp1r18Q8BQ30 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55,26■■■■■ 6,44
Ppp1r18Q8BQ30 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53,75■■■■■ 6,2
Ppp1r18Q8BQ30 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53,35■■■■■ 6,13
Ppp1r18Q8BQ30 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53,24■■■■■ 6,11
Ppp1r18Q8BQ30 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,84■■■■■ 6,05
Ppp1r18Q8BQ30 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,69■■■■■ 6,02
Ppp1r18Q8BQ30 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52,4■■■■■ 5,98
Ppp1r18Q8BQ30 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52,34■■■■■ 5,97
Ppp1r18Q8BQ30 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51,98■■■■■ 5,91
Ppp1r18Q8BQ30 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51,55■■■■■ 5,84
Ppp1r18Q8BQ30 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,52■■■■■ 5,84
Ppp1r18Q8BQ30 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,52■■■■■ 5,84
Ppp1r18Q8BQ30 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51,27■■■■■ 5,8
Ppp1r18Q8BQ30 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,35■■■■■ 5,65
Ppp1r18Q8BQ30 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,3■■■■■ 5,64
Ppp1r18Q8BQ30 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50,22■■■■■ 5,63
Ppp1r18Q8BQ30 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50,11■■■■■ 5,61
Ppp1r18Q8BQ30 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,02■■■■■ 5,6
Ppp1r18Q8BQ30 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49,92■■■■■ 5,58
Ppp1r18Q8BQ30 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49,03■■■■■ 5,44
Ppp1r18Q8BQ30 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49,02■■■■■ 5,44
Ppp1r18Q8BQ30 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,82■■■■■ 5,41
Ppp1r18Q8BQ30 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48,63■■■■■ 5,38
Ppp1r18Q8BQ30 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48,3■■■■■ 5,32
Ppp1r18Q8BQ30 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48,26■■■■■ 5,32
Ppp1r18Q8BQ30 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5,27
Ppp1r18Q8BQ30 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47,99■■■■■ 5,27
Ppp1r18Q8BQ30 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Ppp1r18Q8BQ30 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47,97■■■■■ 5,27
Ppp1r18Q8BQ30 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47,95■■■■■ 5,27
Ppp1r18Q8BQ30 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,68■■■■■ 5,22
Ppp1r18Q8BQ30 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47,58■■■■■ 5,21
Ppp1r18Q8BQ30 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47,55■■■■■ 5,2
Ppp1r18Q8BQ30 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47,53■■■■■ 5,2
Ppp1r18Q8BQ30 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,5■■■■■ 5,19
Ppp1r18Q8BQ30 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,4■■■■■ 5,18
Ppp1r18Q8BQ30 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,38■■■■■ 5,18
Ppp1r18Q8BQ30 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,31■■■■■ 5,16
Ppp1r18Q8BQ30 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,27■■■■■ 5,16
Ppp1r18Q8BQ30 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,25■■■■■ 5,15
Ppp1r18Q8BQ30 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,08■■■■■ 5,13
Ppp1r18Q8BQ30 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46,9■■■■■ 5,1
Ppp1r18Q8BQ30 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46,86■■■■■ 5,09
Ppp1r18Q8BQ30 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46,85■■■■■ 5,09
Ppp1r18Q8BQ30 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46,82■■■■■ 5,09
Ppp1r18Q8BQ30 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46,77■■■■■ 5,08
Ppp1r18Q8BQ30 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46,7■■■■■ 5,07
Ppp1r18Q8BQ30 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,63■■■■■ 5,05
Ppp1r18Q8BQ30 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46,58■■■■■ 5,05
Ppp1r18Q8BQ30 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46,57■■■■■ 5,05
Ppp1r18Q8BQ30 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,34■■■■■ 5,01
Ppp1r18Q8BQ30 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46,28■■■■■ 5
Ppp1r18Q8BQ30 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46,26■■■■■ 5
Ppp1r18Q8BQ30 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46,2■■■■■ 4,99
Ppp1r18Q8BQ30 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46,17■■■■■ 4,98
Ppp1r18Q8BQ30 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,04■■■■■ 4,96
Ppp1r18Q8BQ30 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,94■■■■■ 4,94
Ppp1r18Q8BQ30 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,93■■■■■ 4,94
Ppp1r18Q8BQ30 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,92■■■■■ 4,94
Ppp1r18Q8BQ30 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,88■■■■■ 4,93
Ppp1r18Q8BQ30 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
Ppp1r18Q8BQ30 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45,83■■■■■ 4,93
Ppp1r18Q8BQ30 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45,77■■■■■ 4,92
Ppp1r18Q8BQ30 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,65■■■■■ 4,9
Ppp1r18Q8BQ30 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45,53■■■■■ 4,88
Ppp1r18Q8BQ30 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,49■■■■■ 4,87
Ppp1r18Q8BQ30 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,33■■■■■ 4,85
Ppp1r18Q8BQ30 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45,33■■■■■ 4,85
Ppp1r18Q8BQ30 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45,28■■■■■ 4,84
Ppp1r18Q8BQ30 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45,25■■■■■ 4,83
Ppp1r18Q8BQ30 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45,14■■■■■ 4,82
Ppp1r18Q8BQ30 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45,1■■■■■ 4,81
Ppp1r18Q8BQ30 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,07■■■■■ 4,81
Ppp1r18Q8BQ30 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45,05■■■■■ 4,8
Ppp1r18Q8BQ30 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45,03■■■■■ 4,8
Ppp1r18Q8BQ30 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Ppp1r18Q8BQ30 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45,01■■■■■ 4,8
Ppp1r18Q8BQ30 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44,99■■■■■ 4,79
Ppp1r18Q8BQ30 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,88■■■■■ 4,78
Ppp1r18Q8BQ30 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,85■■■■■ 4,77
Ppp1r18Q8BQ30 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,85■■■■■ 4,77
Ppp1r18Q8BQ30 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,83■■■■■ 4,77
Ppp1r18Q8BQ30 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44,81■■■■■ 4,76
Ppp1r18Q8BQ30 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,8■■■■■ 4,76
Ppp1r18Q8BQ30 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,79■■■■■ 4,76
Ppp1r18Q8BQ30 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
Ppp1r18Q8BQ30 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,77■■■■■ 4,76
Ppp1r18Q8BQ30 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,75■■■■■ 4,75
Ppp1r18Q8BQ30 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Ppp1r18Q8BQ30 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,69■■■■■ 4,74
Ppp1r18Q8BQ30 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,65■■■■■ 4,74
Ppp1r18Q8BQ30 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44,55■■■■■ 4,72
Ppp1r18Q8BQ30 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44,53■■■■■ 4,72
Ppp1r18Q8BQ30 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44,45■■■■■ 4,71
Ppp1r18Q8BQ30 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,45■■■■■ 4,71
Ppp1r18Q8BQ30 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,43■■■■■ 4,7
Ppp1r18Q8BQ30 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,42■■■■■ 4,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms