RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NischQ80TM9 1593 aa50,75■■■■■ 5,71
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,15■■■■■ 5,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rhox8Q6VSS7 320 aa47,26■■■■■ 5,16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rtl1Q7M732 1744 aa46,41■■■■■ 5,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45,63■■■■■ 4,9
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ScribQ80U72 1612 aa44,88■■■■■ 4,77
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,82■■■■■ 4,76
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,49■■■■■ 4,71
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm5dQ62240 1548 aa44,07■■■■■ 4,65
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Baz1aO88379 1555 aa43,93■■■■■ 4,62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,86■■■■■ 4,61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NacadQ5SWP3 1504 aa43,63■■■■■ 4,58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HrcG5E8J6 738 aa43,51■■■■■ 4,56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa43,15■■■■■ 4,5
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42,99■■■■■ 4,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,96■■■■■ 4,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim41Q5NCC3 630 aa42,81■■■■■ 4,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP42,8■■■■■ 4,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP42,7■■■■■ 4,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,7■■■■■ 4,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep164Q5DU05 1446 aa42,25■■■■■ 4,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42■■■■■ 4,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,94■■■■■ 4,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,92■■■■■ 4,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BicraF8VPZ9 1578 aa41,79■■■■■ 4,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP41,78■■■■■ 4,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chic1Q8CBW7 227 aa41,77■■■■■ 4,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,65■■■■■ 4,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golga3P55937 1487 aa41,57■■■■■ 4,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,51■■■■■ 4,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gab3Q8BSM5 595 aa41,5■■■■■ 4,23
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41,24■■■■■ 4,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,06■■■■■ 4,16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Top2bQ64511 1612 aa41,06■■■■■ 4,16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcgf6Q99NA9 353 aa40,96■■■■■ 4,15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40,89■■■■■ 4,14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,75■■■■■ 4,11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fmn1Q05860 1466 aa40,42■■■■■ 4,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP40,42■■■■■ 4,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mier1Q5UAK0 511 aa40,42■■■■■ 4,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40,35■■■■■ 4,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa40,33■■■■■ 4,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40,29■■■■■ 4,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NefmP08553 848 aa40,2■■■■■ 4,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zeb1Q64318 1117 aa40,1■■■■■ 4,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,06■■■■■ 4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep162Q6ZQ06 1403 aa40,03■■■■■ 4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myt1lP97500 1187 aa39,97■■■■□ 3,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UbtfP25976 765 aaKnown RBP39,94■■■■□ 3,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Npm2Q80W85 207 aa39,82■■■■□ 3,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP39,81■■■■□ 3,96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TnnQ80Z71 1560 aa39,69■■■■□ 3,94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP39,62■■■■□ 3,93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,56■■■■□ 3,92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,49■■■■□ 3,91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clip1Q922J3 1391 aa39,48■■■■□ 3,91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sall2Q9QX96 1004 aa39,47■■■■□ 3,91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa39,37■■■■□ 3,89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprkP35822 1457 aa39,35■■■■□ 3,89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap35Q91YM2 1499 aa39,33■■■■□ 3,89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,32■■■■□ 3,89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il27Q8K3I6 234 aa39,28■■■■□ 3,88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,25■■■■□ 3,87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurod1Q60867 357 aa39,24■■■■□ 3,87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NrkQ9R0G8 1455 aa39,21■■■■□ 3,87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP39,19■■■■□ 3,86
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ercc6F8VPZ5 1481 aa39,16■■■■□ 3,86
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39,15■■■■□ 3,86
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP39,1■■■■□ 3,85
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,07■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr66E9Q743 1299 aa39,05■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shroom4Q1W617 1475 aa39,05■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa39,02■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arap1Q4LDD4 1452 aa39,02■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eea1Q8BL66 1411 aa39,01■■■■□ 3,84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa38,94■■■■□ 3,82
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd5Q5XJV7 1441 aa38,87■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TonslQ6NZL6 1363 aa38,86■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k1P53349 1493 aa38,86■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa38,83■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin2bQ01097 1482 aa38,83■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc18Q640L5 1455 aa38,82■■■■□ 3,81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ClspnQ80YR7 1315 aa38,74■■■■□ 3,79
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38,69■■■■□ 3,78
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa38,66■■■■□ 3,78
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Baz1bQ9Z277 1479 aa38,64■■■■□ 3,78
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tiam1Q60610 1591 aa38,57■■■■□ 3,77
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP38,57■■■■□ 3,77
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cux2P70298 1426 aa38,53■■■■□ 3,76
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd26Q811D2 1581 aa38,53■■■■□ 3,76
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Erich3F6QRE9 1637 aa38,5■■■■□ 3,75
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm5bQ80Y84 1544 aa38,49■■■■□ 3,75
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,47■■■■□ 3,75
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naip1Q9QWK5 1403 aa38,47■■■■□ 3,75
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38,43■■■■□ 3,74
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP38,43■■■■□ 3,74
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