RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NischQ80TM9 1593 aa50.75■■■■■ 5.71
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44.49■■■■■ 4.71
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NacadQ5SWP3 1504 aa43.63■■■■■ 4.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HrcG5E8J6 738 aa43.51■■■■■ 4.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa43.15■■■■■ 4.5
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42■■■■■ 4.31
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Synj1Q8CHC4 1574 aa41.65■■■■■ 4.26
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41.51■■■■■ 4.24
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.75■■■■■ 4.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fmn1Q05860 1466 aa40.42■■■■■ 4.06
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mier1Q5UAK0 511 aa40.42■■■■■ 4.06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.35■■■■■ 4.05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa40.33■■■■■ 4.05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clip1Q922J3 1391 aa39.48■■■■□ 3.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sall2Q9QX96 1004 aa39.47■■■■□ 3.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa39.37■■■■□ 3.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprkP35822 1457 aa39.35■■■■□ 3.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap35Q91YM2 1499 aa39.33■■■■□ 3.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39.32■■■■□ 3.89
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il27Q8K3I6 234 aa39.28■■■■□ 3.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif15Q6P9L6 1387 aa39.25■■■■□ 3.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurod1Q60867 357 aa39.24■■■■□ 3.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NrkQ9R0G8 1455 aa39.21■■■■□ 3.87
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.15■■■■□ 3.86
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr66E9Q743 1299 aa39.05■■■■□ 3.84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shroom4Q1W617 1475 aa39.05■■■■□ 3.84
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arap1Q4LDD4 1452 aa39.02■■■■□ 3.84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eea1Q8BL66 1411 aa39.01■■■■□ 3.84
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd5Q5XJV7 1441 aa38.87■■■■□ 3.81
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k1P53349 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa38.83■■■■□ 3.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin2bQ01097 1482 aa38.83■■■■□ 3.81
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cux2P70298 1426 aa38.53■■■■□ 3.76
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38.43■■■■□ 3.74
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
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