Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc9Q8VC31 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc9Q8VC31 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ccdc9Q8VC31 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc9Q8VC31 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc9Q8VC31 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc9Q8VC31 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc9Q8VC31 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc9Q8VC31 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc9Q8VC31 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc9Q8VC31 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc9Q8VC31 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc9Q8VC31 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc9Q8VC31 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc9Q8VC31 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc9Q8VC31 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc9Q8VC31 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc9Q8VC31 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc9Q8VC31 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc9Q8VC31 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc9Q8VC31 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc9Q8VC31 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc9Q8VC31 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc9Q8VC31 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc9Q8VC31 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc9Q8VC31 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc9Q8VC31 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc9Q8VC31 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc9Q8VC31 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc9Q8VC31 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc9Q8VC31 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc9Q8VC31 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc9Q8VC31 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc9Q8VC31 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc9Q8VC31 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ccdc9Q8VC31 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc9Q8VC31 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc9Q8VC31 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc9Q8VC31 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc9Q8VC31 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc9Q8VC31 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc9Q8VC31 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc9Q8VC31 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc9Q8VC31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc9Q8VC31 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc9Q8VC31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc9Q8VC31 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc9Q8VC31 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc9Q8VC31 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc9Q8VC31 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc9Q8VC31 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc9Q8VC31 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc9Q8VC31 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ccdc9Q8VC31 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc9Q8VC31 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc9Q8VC31 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc9Q8VC31 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc9Q8VC31 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc9Q8VC31 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc9Q8VC31 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc9Q8VC31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc9Q8VC31 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc9Q8VC31 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc9Q8VC31 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc9Q8VC31 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc9Q8VC31 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc9Q8VC31 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc9Q8VC31 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc9Q8VC31 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc9Q8VC31 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc9Q8VC31 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc9Q8VC31 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc9Q8VC31 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc9Q8VC31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc9Q8VC31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc9Q8VC31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc9Q8VC31 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc9Q8VC31 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc9Q8VC31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc9Q8VC31 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc9Q8VC31 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc9Q8VC31 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc9Q8VC31 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc9Q8VC31 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc9Q8VC31 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc9Q8VC31 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc9Q8VC31 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc9Q8VC31 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc9Q8VC31 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc9Q8VC31 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc9Q8VC31 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc9Q8VC31 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc9Q8VC31 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc9Q8VC31 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc9Q8VC31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc9Q8VC31 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc9Q8VC31 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms