Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
Ccdc171E9Q1U1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Ccdc171E9Q1U1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Ccdc171E9Q1U1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Ccdc171E9Q1U1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ccdc171E9Q1U1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc171E9Q1U1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccdc171E9Q1U1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Ccdc171E9Q1U1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Ccdc171E9Q1U1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
Ccdc171E9Q1U1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc171E9Q1U1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc171E9Q1U1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ccdc171E9Q1U1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ccdc171E9Q1U1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc171E9Q1U1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc171E9Q1U1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc171E9Q1U1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc171E9Q1U1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc171E9Q1U1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc171E9Q1U1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc171E9Q1U1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc171E9Q1U1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc171E9Q1U1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ccdc171E9Q1U1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc171E9Q1U1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc171E9Q1U1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc171E9Q1U1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ccdc171E9Q1U1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc171E9Q1U1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ccdc171E9Q1U1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc171E9Q1U1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc171E9Q1U1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc171E9Q1U1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc171E9Q1U1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc171E9Q1U1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc171E9Q1U1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc171E9Q1U1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ccdc171E9Q1U1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc171E9Q1U1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc171E9Q1U1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc171E9Q1U1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc171E9Q1U1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc171E9Q1U1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc171E9Q1U1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc171E9Q1U1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc171E9Q1U1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc171E9Q1U1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc171E9Q1U1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc171E9Q1U1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc171E9Q1U1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc171E9Q1U1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc171E9Q1U1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc171E9Q1U1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc171E9Q1U1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc171E9Q1U1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc171E9Q1U1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc171E9Q1U1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc171E9Q1U1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc171E9Q1U1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc171E9Q1U1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc171E9Q1U1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc171E9Q1U1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc171E9Q1U1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc171E9Q1U1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc171E9Q1U1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc171E9Q1U1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc171E9Q1U1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Ccdc171E9Q1U1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc171E9Q1U1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc171E9Q1U1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc171E9Q1U1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc171E9Q1U1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc171E9Q1U1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc171E9Q1U1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc171E9Q1U1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc171E9Q1U1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc171E9Q1U1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc171E9Q1U1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc171E9Q1U1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc171E9Q1U1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc171E9Q1U1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc171E9Q1U1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
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