Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
SkilQ60665 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SkilQ60665 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SkilQ60665 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SkilQ60665 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SkilQ60665 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SkilQ60665 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SkilQ60665 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
SkilQ60665 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SkilQ60665 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SkilQ60665 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SkilQ60665 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SkilQ60665 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SkilQ60665 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
SkilQ60665 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SkilQ60665 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SkilQ60665 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SkilQ60665 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SkilQ60665 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SkilQ60665 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SkilQ60665 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SkilQ60665 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SkilQ60665 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SkilQ60665 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SkilQ60665 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SkilQ60665 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
SkilQ60665 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SkilQ60665 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SkilQ60665 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SkilQ60665 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SkilQ60665 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SkilQ60665 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SkilQ60665 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SkilQ60665 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SkilQ60665 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SkilQ60665 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SkilQ60665 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SkilQ60665 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SkilQ60665 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SkilQ60665 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SkilQ60665 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SkilQ60665 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SkilQ60665 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SkilQ60665 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SkilQ60665 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SkilQ60665 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SkilQ60665 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SkilQ60665 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SkilQ60665 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SkilQ60665 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SkilQ60665 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SkilQ60665 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SkilQ60665 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SkilQ60665 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SkilQ60665 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SkilQ60665 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SkilQ60665 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SkilQ60665 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SkilQ60665 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SkilQ60665 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SkilQ60665 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SkilQ60665 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SkilQ60665 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SkilQ60665 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SkilQ60665 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SkilQ60665 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SkilQ60665 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SkilQ60665 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SkilQ60665 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SkilQ60665 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SkilQ60665 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SkilQ60665 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SkilQ60665 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SkilQ60665 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SkilQ60665 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SkilQ60665 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SkilQ60665 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SkilQ60665 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SkilQ60665 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SkilQ60665 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SkilQ60665 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SkilQ60665 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SkilQ60665 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SkilQ60665 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SkilQ60665 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SkilQ60665 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SkilQ60665 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SkilQ60665 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SkilQ60665 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SkilQ60665 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SkilQ60665 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SkilQ60665 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SkilQ60665 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SkilQ60665 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SkilQ60665 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SkilQ60665 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SkilQ60665 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SkilQ60665 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SkilQ60665 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SkilQ60665 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms