Protein–RNA interactions for Protein: P32507

Nectin2, Nectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin2P32507 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,73■■■■■ 5,23
Nectin2P32507 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,97■■■■■ 4,63
Nectin2P32507 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Nectin2P32507 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,53
Nectin2P32507 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
Nectin2P32507 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42,03■■■■■ 4,32
Nectin2P32507 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Nectin2P32507 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41,24■■■■■ 4,19
Nectin2P32507 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,23■■■■■ 4,19
Nectin2P32507 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Nectin2P32507 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Nectin2P32507 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Nectin2P32507 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Nectin2P32507 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Nectin2P32507 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,83■■■■□ 3,97
Nectin2P32507 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Nectin2P32507 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Nectin2P32507 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Nectin2P32507 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Nectin2P32507 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Nectin2P32507 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Nectin2P32507 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Nectin2P32507 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Nectin2P32507 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Nectin2P32507 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Nectin2P32507 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Nectin2P32507 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Nectin2P32507 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Nectin2P32507 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,7■■■■□ 3,79
Nectin2P32507 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Nectin2P32507 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Nectin2P32507 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Nectin2P32507 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Nectin2P32507 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Nectin2P32507 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Nectin2P32507 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Nectin2P32507 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Nectin2P32507 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Nectin2P32507 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Nectin2P32507 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Nectin2P32507 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Nectin2P32507 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Nectin2P32507 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Nectin2P32507 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Nectin2P32507 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
Nectin2P32507 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Nectin2P32507 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Nectin2P32507 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Nectin2P32507 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Nectin2P32507 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Nectin2P32507 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Nectin2P32507 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Nectin2P32507 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Nectin2P32507 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Nectin2P32507 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37■■■■□ 3,51
Nectin2P32507 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Nectin2P32507 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Nectin2P32507 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Nectin2P32507 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Nectin2P32507 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Nectin2P32507 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Nectin2P32507 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Nectin2P32507 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Nectin2P32507 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Nectin2P32507 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Nectin2P32507 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Nectin2P32507 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Nectin2P32507 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Nectin2P32507 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Nectin2P32507 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nectin2P32507 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Nectin2P32507 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Nectin2P32507 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Nectin2P32507 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Nectin2P32507 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Nectin2P32507 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Nectin2P32507 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Nectin2P32507 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Nectin2P32507 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nectin2P32507 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Nectin2P32507 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nectin2P32507 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nectin2P32507 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nectin2P32507 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Nectin2P32507 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,95■■■■□ 3,35
Nectin2P32507 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nectin2P32507 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Nectin2P32507 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Nectin2P32507 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Nectin2P32507 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nectin2P32507 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Nectin2P32507 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Nectin2P32507 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Nectin2P32507 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Nectin2P32507 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Nectin2P32507 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nectin2P32507 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Nectin2P32507 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Nectin2P32507 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Nectin2P32507 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms