Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,28■■■■■ 4,68
Atl3Q91YH5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Atl3Q91YH5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
Atl3Q91YH5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,72■■■■■ 4,27
Atl3Q91YH5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Atl3Q91YH5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,29■■■■■ 4,04
Atl3Q91YH5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Atl3Q91YH5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Atl3Q91YH5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,64■■■■□ 3,94
Atl3Q91YH5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Atl3Q91YH5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Atl3Q91YH5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Atl3Q91YH5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Atl3Q91YH5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Atl3Q91YH5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Atl3Q91YH5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Atl3Q91YH5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Atl3Q91YH5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,75
Atl3Q91YH5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Atl3Q91YH5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Atl3Q91YH5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Atl3Q91YH5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Atl3Q91YH5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Atl3Q91YH5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Atl3Q91YH5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Atl3Q91YH5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,81■■■■□ 3,64
Atl3Q91YH5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Atl3Q91YH5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Atl3Q91YH5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Atl3Q91YH5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Atl3Q91YH5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Atl3Q91YH5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Atl3Q91YH5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Atl3Q91YH5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Atl3Q91YH5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Atl3Q91YH5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Atl3Q91YH5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Atl3Q91YH5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Atl3Q91YH5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Atl3Q91YH5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Atl3Q91YH5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Atl3Q91YH5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Atl3Q91YH5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Atl3Q91YH5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Atl3Q91YH5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Atl3Q91YH5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Atl3Q91YH5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Atl3Q91YH5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Atl3Q91YH5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Atl3Q91YH5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Atl3Q91YH5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Atl3Q91YH5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Atl3Q91YH5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Atl3Q91YH5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Atl3Q91YH5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Atl3Q91YH5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Atl3Q91YH5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Atl3Q91YH5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,62■■■■□ 3,29
Atl3Q91YH5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atl3Q91YH5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Atl3Q91YH5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Atl3Q91YH5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Atl3Q91YH5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Atl3Q91YH5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Atl3Q91YH5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Atl3Q91YH5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Atl3Q91YH5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Atl3Q91YH5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,25
Atl3Q91YH5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Atl3Q91YH5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Atl3Q91YH5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Atl3Q91YH5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Atl3Q91YH5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Atl3Q91YH5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Atl3Q91YH5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Atl3Q91YH5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Atl3Q91YH5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Atl3Q91YH5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Atl3Q91YH5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Atl3Q91YH5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Atl3Q91YH5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Atl3Q91YH5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Atl3Q91YH5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Atl3Q91YH5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Atl3Q91YH5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Atl3Q91YH5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Atl3Q91YH5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Atl3Q91YH5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Atl3Q91YH5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Atl3Q91YH5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Atl3Q91YH5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Atl3Q91YH5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Atl3Q91YH5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atl3Q91YH5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Atl3Q91YH5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Atl3Q91YH5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Atl3Q91YH5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms