Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Sptbn5F6UCX4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Sptbn5F6UCX4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Sptbn5F6UCX4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sptbn5F6UCX4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Sptbn5F6UCX4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sptbn5F6UCX4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Sptbn5F6UCX4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sptbn5F6UCX4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Sptbn5F6UCX4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Sptbn5F6UCX4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sptbn5F6UCX4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sptbn5F6UCX4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sptbn5F6UCX4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Sptbn5F6UCX4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Sptbn5F6UCX4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Sptbn5F6UCX4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Sptbn5F6UCX4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Sptbn5F6UCX4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Sptbn5F6UCX4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sptbn5F6UCX4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sptbn5F6UCX4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sptbn5F6UCX4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Sptbn5F6UCX4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sptbn5F6UCX4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sptbn5F6UCX4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sptbn5F6UCX4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sptbn5F6UCX4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Sptbn5F6UCX4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Sptbn5F6UCX4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sptbn5F6UCX4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sptbn5F6UCX4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sptbn5F6UCX4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sptbn5F6UCX4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sptbn5F6UCX4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sptbn5F6UCX4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Sptbn5F6UCX4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Sptbn5F6UCX4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Sptbn5F6UCX4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sptbn5F6UCX4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sptbn5F6UCX4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Sptbn5F6UCX4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sptbn5F6UCX4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sptbn5F6UCX4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sptbn5F6UCX4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sptbn5F6UCX4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sptbn5F6UCX4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Sptbn5F6UCX4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Sptbn5F6UCX4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Sptbn5F6UCX4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sptbn5F6UCX4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sptbn5F6UCX4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sptbn5F6UCX4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sptbn5F6UCX4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sptbn5F6UCX4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sptbn5F6UCX4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sptbn5F6UCX4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sptbn5F6UCX4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sptbn5F6UCX4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Sptbn5F6UCX4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sptbn5F6UCX4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sptbn5F6UCX4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sptbn5F6UCX4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sptbn5F6UCX4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Sptbn5F6UCX4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sptbn5F6UCX4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sptbn5F6UCX4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sptbn5F6UCX4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sptbn5F6UCX4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sptbn5F6UCX4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sptbn5F6UCX4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Sptbn5F6UCX4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sptbn5F6UCX4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sptbn5F6UCX4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sptbn5F6UCX4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sptbn5F6UCX4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sptbn5F6UCX4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Sptbn5F6UCX4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Sptbn5F6UCX4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Sptbn5F6UCX4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sptbn5F6UCX4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sptbn5F6UCX4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sptbn5F6UCX4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sptbn5F6UCX4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sptbn5F6UCX4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sptbn5F6UCX4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sptbn5F6UCX4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sptbn5F6UCX4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sptbn5F6UCX4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sptbn5F6UCX4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sptbn5F6UCX4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sptbn5F6UCX4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sptbn5F6UCX4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sptbn5F6UCX4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sptbn5F6UCX4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms