RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col16a1Q8BLX7 1580 aa25.45■■□□□ 1.67
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scn7aB1AYL1 1681 aa25.28■■□□□ 1.64
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnh5Q920E3 988 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Birc3O08863 600 aa25.27■■□□□ 1.64
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map2P20357 1828 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ano8Q6PB70 1060 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.2■■□□□ 1.62
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fmnl2A2APV2 1086 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sema6bO54951 886 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slit2Q9R1B9 1521 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cntnap1O54991 1385 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tex14Q7M6U3 1450 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TnrQ8BYI9 1358 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dnajc10Q9DC23 793 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Robo1O89026 1612 aa25.17■■□□□ 1.62
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rad17Q6NXW6 688 aa25.14■■□□□ 1.61
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Emilin2Q8K482 1074 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MypopQ8R4U1 393 aa25.11■■□□□ 1.61
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Amotl2Q8K371 772 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim28Q62318 834 aa25.1■■□□□ 1.61
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cypt2Q6P924 180 aa25.07■■□□□ 1.6
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 P2rx7Q9Z1M0 595 aa25.02■■□□□ 1.6
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q7TT23 1179 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ptpn23Q6PB44 1692 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccne1Q61457 408 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Parp14Q2EMV9 1817 aa24.98■■□□□ 1.59
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zeb2Q9R0G7 1215 aa24.97■■□□□ 1.59
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