RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col16a1Q8BLX7 1580 aa25.45■■□□□ 1.67
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gimap6Q8K349 305 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp10bB1AWN4 1474 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dixdc1Q80Y83 711 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cadps2Q8BYR5 1297 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ncoa4Q5U4H9 625 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dennd6aQ8BH65 605 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf526Q8BI66 675 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abca15E9PWH4 1668 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam135bQ9DAI6 1403 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CemipQ8BI06 1361 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zmym3Q9JLM4 1370 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nlgn1Q99K10 843 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mdc1Q5PSV9 1707 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dzip1Q8BMD2 852 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sall2Q9QX96 1004 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PaskQ8CEE6 1383 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tet3Q8BG87 1668 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubr1O70481 1757 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcl9lQ67FY2 1494 aa25.31■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cabp4Q8VHC5 271 aa25.3■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxb7P09024 217 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nyap1Q6PFX7 833 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smim5Q8BT42 78 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Acsbg1Q99PU5 721 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scn7aB1AYL1 1681 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Siglec1Q62230 1695 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ZgpatQ8VDM1 511 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnh5Q920E3 988 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Birc3O08863 600 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ggt6Q6PDE7 497 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HdgfP51859 237 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nid2O88322 1403 aa25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map2P20357 1828 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ano8Q6PB70 1060 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa25.23■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nfat5Q9WV30 1534 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FancaQ9JL70 1439 aa25.21■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PtprvP70289 1705 aa25.2■■□□□ 1.63
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21698A0A087WQP8 267 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21671G3UY31 267 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TatQ8QZR1 454 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fmnl2A2APV2 1086 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sema6bO54951 886 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slit2Q9R1B9 1521 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cntnap1O54991 1385 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tex14Q7M6U3 1450 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TnrQ8BYI9 1358 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dnajc10Q9DC23 793 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Robo1O89026 1612 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Card10P58660 1021 aa25.14■■□□□ 1.62
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rad17Q6NXW6 688 aa25.14■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Emilin2Q8K482 1074 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MypopQ8R4U1 393 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rtl5Q5DTT4 599 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Amotl2Q8K371 772 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim28Q62318 834 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrp6O88572 1613 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxc9P09633 260 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nlrp6Q91WS2 869 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cypt2Q6P924 180 aa25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Exoc6Q8R313 802 aa25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem132eQ6IEE6 982 aa25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp1r15aP17564 657 aa25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slx1bQ8BX32 270 aa25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pard3Q99NH2 1333 aa25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 P2rx7Q9Z1M0 595 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q7TT23 1179 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ptpn23Q6PB44 1692 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccne1Q61457 408 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Parp14Q2EMV9 1817 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif4a2P10630 407 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc12a5Q91V14 1138 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zeb2Q9R0G7 1215 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms