RNA–Protein interactions for RNA: YJR119C

JHD2, Transcript of JmjC domain family histone demethylase, yeast

Gene JHD2, Length 2,187 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JHD2	YJR119C	TOS1	P38288	455 aa		5.15	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	BRL1	P38770	471 aa		5.15	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RMD1	Q03441	430 aa		5.15	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RAD50	P12753	1312 aa		5.14	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	MTC5	Q03897	1148 aa		5.14	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	PDR18	P53756	1333 aa		5.14	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	BDF2	Q07442	638 aa		5.14	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	IRC3	Q06683	689 aa		5.13	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RAM2	P29703	316 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	CDC16	P09798	840 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	MLC1	P53141	149 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	UBP16	Q02863	499 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	GYP5	Q12344	894 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SAC3	P46674	1301 aa		5.12	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	CAB3	P36076	571 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	YJL171C	P46992	396 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	YGL242C	P53066	181 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RRI2	Q12348	645 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SWE1	P32944	819 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	MSN5	P52918	1224 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SRC1	Q03707	834 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SAS4	Q04003	481 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	THI3	Q07471	609 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RTG1	P32607	177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	BRN1	P38170	754 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	YNL193W	P53870	558 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	DPH6	Q12429	685 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	MGM1	P32266	881 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	DLD1	P32891	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	YML020W	Q03722	664 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	PFF1	P38244	976 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	EAF6	P47128	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	GCR2	Q01722	534 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
JHD2	YJR119C	ADR1	P07248	1323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	PBY1	P38254	753 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	ICP55	P40051	511 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	CWH41	P53008	833 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	MRPS35	P53292	345 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	POM152	P39685	1337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HXT13	P39924	564 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	PIB2	P53191	635 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HXT17	P53631	564 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	RIM20	Q12033	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HKR1	P41809	1802 aa		5.07	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	SIT4	P20604	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YKL222C	P35995	705 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	ERO1	Q03103	563 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	NCR1	Q12200	1170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	BMT6	Q12291	365 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	SEC61	P32915	480 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	DCW1	P36091	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	ERT1	P38140	529 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	SPL2	P38839	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YIR042C	P40586	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	CTT1	P06115	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	KRE2	P27809	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	ASF1	P32447	279 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	EDS1	P38073	919 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YIR014W	P40570	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	IRC4	Q03036	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	VPS72	Q03388	795 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	INM2	Q05533	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	PIF1	P07271	859 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	DAN4	P47179	1161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	HTA2	P04912	132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
JHD2	YJR119C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.5 ms