RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	APC11	Q12157	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
VMA10	YHR039C-A	LDH1	P38139	375 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	DYS1	P38791	387 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	CEM1	P39525	442 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	SYT1	Q06836	1226 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	RPB10	P22139	70 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	KTR2	P33550	425 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	ERP5	P38819	212 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	QDR1	P40475	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	LYS5	P50113	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	ATG1	P53104	897 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	YGR035C	P53222	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	FPS1	P23900	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	HXT8	P40886	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	YNR040W	P53736	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	MSN1	P22148	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	BSD2	P38356	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	APM2	P38700	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA10	YHR039C-A	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	GIP1	P38229	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	MSC7	P38694	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	MDJ2	P42834	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	ACF4	P47129	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	JJJ3	P47138	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	DPH6	Q12429	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	SLD2	P34252	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	ISW1	P38144	1129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	ITC1	P53125	1264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	TRK2	P28584	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	FIR1	P40020	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	RGD2	P43556	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	HEH2	Q03281	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	SMC1	P32908	1225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	NTA1	P40354	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	TRS120	Q04183	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	YBR287W	P38355	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	RAD55	P38953	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	YIL165C	P40446	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	PRK1	P40494	810 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	UFD2	P54860	961 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	FRT1	Q99332	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA10	YHR039C-A	IDI1	P15496	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	YHL050C	P38721	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	YHR219W	P38900	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	NUT2	Q06213	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	MNL2	Q12205	849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	AIM46	P38885	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	MRP10	O75012	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	HEM3	P28789	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	PSY2	P40164	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	YNL011C	P53980	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	PPT1	P53043	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	RSC4	Q02206	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	GPI13	Q07830	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	RSC2	Q06488	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	AI1	P03875	834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	IPL1	P38991	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	YJL181W	P46987	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	CDC55	Q00362	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	MDJ1	P35191	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	PPX1	P38698	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	CTR9	P89105	1077 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	THI72	Q08579	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA10	YHR039C-A	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SEC20	P28791	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	YFL066C	P43538	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	WHI5	Q12416	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	MET4	P32389	672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	ALG14	P38242	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	GIS4	Q04233	774 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	BSC2	Q05611	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	COB	P00163	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	FUS1	P11710	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	MET1	P36150	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	BOI2	P39969	1040 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.8 ms