RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nwd1A6H603 1563 aa16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Usp32F8VPZ3 1604 aa16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mink1Q9JM52 1308 aa16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gli3Q61602 1583 aa16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CenpjQ569L8 1344 aa16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem94Q7TSH8 1360 aa16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col18a1P39061 1774 aa16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Q3UJC8 639 aa16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col14a1Q80X19 1797 aa16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cdk19Q8BWD8 501 aa16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NktrP30415 1453 aa16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NalcnQ8BXR5 1738 aa16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 InsrP15208 1372 aa16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slain2Q8CI08 581 aa16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plekhg5Q66T02 1073 aa16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc24a1Q91WD8 1130 aa16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm10563F6WIE4 79 aa16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 C3P01027 1663 aa16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 C5P06684 1680 aa16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Evi5lH3BKQ3 813 aa16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gsto1O09131 240 aa16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Amigo3Q8C2S7 508 aa16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 ClspnQ80YR7 1315 aa16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Als2Q920R0 1651 aa16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zranb1Q7M760 708 aa16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sirt1Q923E4 737 aa16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sbno1Q689Z5 1390 aa16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc4a1apE9PX68 744 aa16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cnga1P29974 684 aa16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 FanciQ8K368 1330 aa16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PrxO55103 1391 aa16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Idi1P58044 227 aa16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pank3Q8R2W9 370 aa16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Abcc10Q8R4P9 1501 aa16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam184bQ0KK56 942 aa16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Brinp3Q499E0 766 aa16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Iqsec2Q5DU25 1478 aa16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sall2Q9QX96 1004 aa16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atf3Q60765 181 aa16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Idi2Q8BFZ6 227 aa16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Map3k19E9Q3S4 1311 aa16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sox12Q04890 314 aa16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PtpruB1AUH1 1446 aa16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NgefQ8CHT1 710 aa16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Inpp5dQ9ES52 1191 aa16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mon2Q80TL7 1715 aa16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adgrl1Q80TR1 1466 aa16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem2Q5FWI3 1383 aa16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Wnk3Q80XP9 1757 aa16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ap3b2Q9JME5 1082 aa16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CatipB9EKE5 520 aa16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Camta1A2A891 1682 aa16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nrxn1Q9CS84 1514 aa16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zscan10Q3URR7 782 aa16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kcna6Q61923 529 aa16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Farp2Q91VS8 1065 aa16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hspa1lP16627 641 aa16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bcl11bQ99PV8 884 aa16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NinlQ6ZQ12 1394 aa16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif1aP33173 1695 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf335A2A5K6 1337 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 GnpatP98192 678 aa16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dcaf11Q91VU6 549 aa16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 KdrP35918 1367 aa16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 DccP70211 1447 aa16.21■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif16bB1AVY7 1312 aa16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Wdr17E9Q271 1322 aa16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gimap5Q8BWF2 308 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc35g1Q8BY79 368 aa16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ttll13A4Q9F6 804 aa16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif7B7ZNG0 1348 aa16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pcgf6Q99NA9 353 aa16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pik3c2aQ61194 1686 aa16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif24Q6NWW5 1356 aa16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fyb1O35601 819 aa16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Astn2Q80Z10 1352 aa16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tom1O88746 492 aa16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col16a1Q8BLX7 1580 aa16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TimelessQ9R1X4 1197 aa16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms