RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W RPI1P23250 407 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W YUH1P35127 236 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W YCK3P39962 524 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W MOB1P40484 314 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W ATG39Q06159 398 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W CSM4Q08955 156 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W ATG40Q99325 256 aa10.9□□□□□ -0.66
SSA4YER103W SEC11P15367 167 aa10.9□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YIP5P53108 310 aa10.9□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YAP6Q03935 383 aa10.9□□□□□ -0.67
SSA4YER103W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YAL064W-BO13512 126 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W MSI1P13712 422 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W DER1P38307 211 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W TAF4P50105 388 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YOL118CQ08259 102 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W GEP5Q12393 293 aa10.89□□□□□ -0.67
SSA4YER103W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YFH1Q07540 174 aa10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W CUP2P15315 225 aa10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W MRP49P32388 137 aa10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W PHD1P36093 366 aa10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W CCS1P40202 249 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YOR192C-CQ3E736 78 aa10.88□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YER190C-BP0CX94 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YEL077W-AP0CX95 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YGR296C-BP0CX96 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YPL283W-BP0CX97 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YPR204C-AP0CX98 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W NOP1P15646 327 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W ARO2P28777 376 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W LPP1Q04396 274 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YOR292CQ08743 309 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W SWT1Q12104 458 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W SCS22Q6Q595 175 aa10.87□□□□□ -0.67
SSA4YER103W RML2P32611 393 aa10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W CPD1P53314 239 aa10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W SLO1Q3E784 85 aa10.86□□□□□ -0.67
SSA4YER103W PAI3P01094 68 aa10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W SEC4P07560 215 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W ANB1P19211 157 aa10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W MSY1P48527 492 aa10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W TNA1P53322 534 aa10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W FIT3Q08907 204 aa10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SSA4YER103W LSM2P38203 95 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YJR115WP47152 169 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W DSK2P48510 373 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YGR017WP53210 297 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W RKI1Q12189 258 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W YBR090CP38253 122 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W HNT3Q08702 217 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W USB1Q12208 290 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W ATO3Q12359 275 aa10.84□□□□□ -0.67
SSA4YER103W QRI5P32344 111 aa10.83□□□□□ -0.68
SSA4YER103W UBS1P38290 277 aa10.83□□□□□ -0.68
SSA4YER103W MRL1Q06815 381 aa10.83□□□□□ -0.68
SSA4YER103W PCL7P40186 285 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W PRM5P40476 318 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W SEC24P40482 926 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W ABM1P47146 123 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YDR344CQ05510 147 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W POM34Q12445 299 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W VPS13Q07878 3144 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W HMRA1P0CY11 126 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YHL044WP38727 235 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W GPP2P40106 250 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W TDA4P47153 279 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YNR061CP53747 219 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YNR064CP53750 290 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W RIM9Q04734 239 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YLR363W-AQ3E747 85 aa10.82□□□□□ -0.68
SSA4YER103W ZRT1P32804 376 aa10.81□□□□□ -0.68
SSA4YER103W SHO1P40073 367 aa10.81□□□□□ -0.68
SSA4YER103W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SSA4YER103W ARP3P47117 449 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YGL118CP53132 145 aa10.81□□□□□ -0.68
SSA4YER103W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
SSA4YER103W BOR1P53838 576 aa10.8□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
SSA4YER103W WSC2P53832 503 aa10.8□□□□□ -0.68
SSA4YER103W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YJR015WP47090 510 aa10.79□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YDL180WQ12301 547 aa10.79□□□□□ -0.68
SSA4YER103W RPS2P25443 254 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W PSD1P39006 500 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W HRD1Q08109 551 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms