Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.07■□□□□ 0.48
YDL180WQ12301 NSR1YGR159C 1245 nt17.92■□□□□ 0.46
YDL180WQ12301 NOP1YDL014W 984 nt17.64■□□□□ 0.41
YDL180WQ12301 YKL036CYKL036C 393 nt16.31■□□□□ 0.2
YDL180WQ12301 MDJ1YFL016C 1536 nt15.79■□□□□ 0.12
YDL180WQ12301 Q0297Q0297 156 nt15.44■□□□□ 0.06
YDL180WQ12301 SRX1YKL086W 384 nt15.39■□□□□ 0.05
YDL180WQ12301 YJL027CYJL027C 417 nt15.24■□□□□ 0.03
YDL180WQ12301 SCS3YGL126W 1143 nt14.85□□□□□ -0.03
YDL180WQ12301 YCR051WYCR051W 669 nt14.58□□□□□ -0.08
YDL180WQ12301 YOL085CYOL085C 342 nt14.1□□□□□ -0.15
YDL180WQ12301 DBP2YNL112W 1641 nt13.99□□□□□ -0.17
YDL180WQ12301 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 RPP1BYDL130W 321 nt13.85□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 PKP1YIL042C 1185 nt13.84□□□□□ -0.19
YDL180WQ12301 CCC1YLR220W 969 nt13.69□□□□□ -0.22
YDL180WQ12301 YBR190WYBR190W 312 nt13.5□□□□□ -0.25
YDL180WQ12301 SCJ1YMR214W 1134 nt13.31□□□□□ -0.28
YDL180WQ12301 ATS1YAL020C 1002 nt13.3□□□□□ -0.28
YDL180WQ12301 RVS167YDR388W 1449 nt13.26□□□□□ -0.29
YDL180WQ12301 PET122YER153C 765 nt13.2□□□□□ -0.3
YDL180WQ12301 RTC3YHR087W 336 nt13.18□□□□□ -0.3
YDL180WQ12301 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.13□□□□□ -0.31
YDL180WQ12301 SCR1SCR1 522 nt13.13□□□□□ -0.31
YDL180WQ12301 RRN5YLR141W 1092 nt12.81□□□□□ -0.36
YDL180WQ12301 SHR5YOL110W 714 nt12.79□□□□□ -0.36
YDL180WQ12301 YDJ1YNL064C 1230 nt12.73□□□□□ -0.37
YDL180WQ12301 RSB1YOR049C 1065 nt12.59□□□□□ -0.39
YDL180WQ12301 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.56□□□□□ -0.4
YDL180WQ12301 GAR1YHR089C 618 nt12.39□□□□□ -0.43
YDL180WQ12301 URN1YPR152C 1398 nt12.37□□□□□ -0.43
YDL180WQ12301 DEP1YAL013W 1218 nt12.34□□□□□ -0.43
YDL180WQ12301 PST2YDR032C 597 nt12.3□□□□□ -0.44
YDL180WQ12301 RPN10YHR200W 807 nt12.26□□□□□ -0.45
YDL180WQ12301 YNL208WYNL208W 600 nt12.22□□□□□ -0.45
YDL180WQ12301 OPI9YLR338W 858 nt12.19□□□□□ -0.46
YDL180WQ12301 PUT4YOR348C 1884 nt12.16□□□□□ -0.46
YDL180WQ12301 SAH1YER043C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
YDL180WQ12301 TIR1YER011W 765 nt11.99□□□□□ -0.49
YDL180WQ12301 SSA3YBL075C 1950 nt11.98□□□□□ -0.49
YDL180WQ12301 ARE1YCR048W 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
YDL180WQ12301 YKL097CYKL097C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
YDL180WQ12301 PUN1YLR414C 792 nt11.86□□□□□ -0.51
YDL180WQ12301 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.83□□□□□ -0.52
YDL180WQ12301 YJR018WYJR018W 363 nt11.81□□□□□ -0.52
YDL180WQ12301 SSA1YAL005C 1929 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL180WQ12301 SHU1YHL006C 453 nt11.77□□□□□ -0.53
YDL180WQ12301 POA1YBR022W 534 nt11.77□□□□□ -0.53
YDL180WQ12301 PTC2YER089C 1395 nt11.65□□□□□ -0.55
YDL180WQ12301 RPP2BYDR382W 333 nt11.62□□□□□ -0.55
YDL180WQ12301 YJR120WYJR120W 351 nt11.61□□□□□ -0.55
YDL180WQ12301 SRB2YHR041C 633 nt11.57□□□□□ -0.56
YDL180WQ12301 BUD23YCR047C 828 nt11.55□□□□□ -0.56
YDL180WQ12301 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.53□□□□□ -0.56
YDL180WQ12301 BSC6YOL137W 1494 nt11.52□□□□□ -0.56
YDL180WQ12301 NAB2YGL122C 1578 nt11.52□□□□□ -0.57
YDL180WQ12301 YGR021WYGR021W 873 nt11.48□□□□□ -0.57
YDL180WQ12301 WWM1YFL010C 636 nt11.45□□□□□ -0.58
YDL180WQ12301 INM2YDR287W 879 nt11.41□□□□□ -0.58
YDL180WQ12301 HOM6YJR139C 1080 nt11.4□□□□□ -0.58
YDL180WQ12301 BDH2YAL061W 1254 nt11.39□□□□□ -0.59
YDL180WQ12301 DAL1YIR027C 1383 nt11.39□□□□□ -0.59
YDL180WQ12301 FIS1YIL065C 468 nt11.35□□□□□ -0.59
YDL180WQ12301 YOR139CYOR139C 393 nt11.35□□□□□ -0.59
YDL180WQ12301 FPR4YLR449W 1179 nt11.33□□□□□ -0.6
YDL180WQ12301 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.32□□□□□ -0.6
YDL180WQ12301 MNP1YGL068W 585 nt11.32□□□□□ -0.6
YDL180WQ12301 NPL3YDR432W 1245 nt11.29□□□□□ -0.6
YDL180WQ12301 YBL100CYBL100C 315 nt11.29□□□□□ -0.6
YDL180WQ12301 PHO4YFR034C 939 nt11.27□□□□□ -0.61
YDL180WQ12301 LSM3YLR438C-A 270 nt11.26□□□□□ -0.61
YDL180WQ12301 YOL037CYOL037C 354 nt11.24□□□□□ -0.61
YDL180WQ12301 RKM5YLR137W 1104 nt11.23□□□□□ -0.61
YDL180WQ12301 TRM9YML014W 840 nt11.15□□□□□ -0.62
YDL180WQ12301 FUN26YAL022C 1554 nt11.15□□□□□ -0.62
YDL180WQ12301 CCT6YDR188W 1641 nt11.05□□□□□ -0.64
YDL180WQ12301 SPT5YML010W 3192 nt11.05□□□□□ -0.64
YDL180WQ12301 YPS1YLR120C 1710 nt11.01□□□□□ -0.65
YDL180WQ12301 ALF1YNL148C 765 nt11□□□□□ -0.65
YDL180WQ12301 YDR095CYDR095C 411 nt10.98□□□□□ -0.65
YDL180WQ12301 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.98□□□□□ -0.65
YDL180WQ12301 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.98□□□□□ -0.65
YDL180WQ12301 YLR281CYLR281C 468 nt10.92□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL180WQ12301 WHI5YOR083W 888 nt10.87□□□□□ -0.67
YDL180WQ12301 PUS2YGL063W 1113 nt10.82□□□□□ -0.68
YDL180WQ12301 SIS1YNL007C 1059 nt10.82□□□□□ -0.68
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