RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YNR064C	P53750	290 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	BUD25	P85052	153 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	PRM15	Q03262	622 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	PRM4	Q12498	284 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	OTU1	P43558	301 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SOL1	P50278	321 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	OKP1	P53298	406 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SCW10	Q04951	389 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YDR286C	Q05530	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SCM3	Q12334	223 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	RDI1	Q12434	202 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	PET20	Q99373	253 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	RNP1	P32385	249 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YUH1	P35127	236 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	CPR5	P35176	225 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GPI18	P38211	433 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YKE4	P40544	346 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GON7	P46984	123 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
PAM17	YKR065C	MRPS16	Q02608	121 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YML018C	Q03730	393 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YOL029C	Q08187	201 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	MED4	Q12343	284 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	DGK1	Q12382	290 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	GEP5	Q12393	293 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	REP2	P03872	296 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	RPL39	P04650	51 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	CKA1	P15790	372 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	IES6	P32617	166 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YIR020C	P40575	100 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	DIE2	P50076	525 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	ARR2	Q06597	130 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SOR2	Q07786	357 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	IRC25	Q07951	179 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	SCP1	Q08873	200 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	BBP1	Q12365	385 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	UBA3	Q99344	299 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PAM17	YKR065C	OCH1	P31755	480 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.02	□□□□□ -1.45	not detected
PAM17	YKR065C	SLM1	P40485	686 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YIL012W	P40551	113 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	NCA3	P46955	337 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	TTI2	P47168	421 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	INN1	P53901	409 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	MEH1	Q02205	184 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	VBA1	Q04301	562 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	FRE8	Q12209	686 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	VAM3	Q12241	283 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YLR108C	Q12259	485 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RTR2	Q12378	196 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ATP10	P18496	279 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	FMT1	P32785	401 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	SRY1	P36007	326 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YHC3	P47040	408 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	BNA1	P47096	177 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	HSK3	P69852	69 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	FIT1	Q04433	528 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	SYM1	Q06563	197 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YDL009C	Q12210	107 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	MRP17	P28778	131 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	MRP20	P32387	263 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPB7	P34087	171 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	SWD3	P38123	315 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RTS2	P40962	232 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	MRPL13	Q02204	264 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	CAB5	Q03941	241 aa		6	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ATG22	P25568	528 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	SUA5	P32579	426 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YPC1	P38298	316 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	POP2	P39008	433 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	SWM2	P40342	146 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RFM1	Q12192	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45

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