RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W SIT4P20604 311 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W RAD24P32641 659 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W EAF6P47128 113 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W MSN5P52918 1224 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W UBP16Q02863 499 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W MTC5Q03897 1148 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W CSI1Q04368 295 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W BDF2Q07442 638 aa7.35□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W YGR122WP53272 402 aa7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W ERO1Q03103 563 aa7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W CTI6Q08923 506 aa7.34□□□□□ -1.23
CIN4YMR138W UBP12P39538 1254 aa7.33□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W PRY3P47033 881 aa7.33□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W ITC1P53125 1264 aa7.33□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W KIN4Q01919 800 aa7.33□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W DAL5P15365 543 aa7.32□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W SMY1P32364 656 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W FCP1Q03254 732 aa7.32□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W PKH1Q03407 766 aa7.31□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W SWC3P31376 625 aa7.3□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W CWH41P53008 833 aa7.3□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W POL32P47110 350 aa7.29□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W IRC3Q06683 689 aa7.29□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W PSH1Q12161 406 aa7.29□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W YNG2P38806 282 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W ADR1P07248 1323 aa7.27□□□□□ -1.24
CIN4YMR138W SUP35P05453 685 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W DPH6Q12429 685 aa7.27□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W FRD1P32614 470 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W ICP55P40051 511 aa7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W HXT10P43581 546 aa7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SPO1P53541 631 aa7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W GRX6Q12438 231 aa7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W FIG2P25653 1609 aa7.26□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W PMD1P32634 1753 aa7.25□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W KRE2P27809 442 aa7.25□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SHC1P39000 512 aa7.24□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SAS4Q04003 481 aa7.24□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W UBX2Q04228 584 aa7.24□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W CAF20P12962 161 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SPL2P38839 148 aa7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W NUG1P40010 520 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W GYP5Q12344 894 aa7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W POM152P39685 1337 aa7.23□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W RET1P22276 1149 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W MGM1P32266 881 aa7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W YKU70P32807 602 aa7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W FPK1P53739 893 aa7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CIN4YMR138W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W THI3Q07471 609 aa7.21□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W HKR1P41809 1802 aa7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W CDC16P09798 840 aa7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W SEC18P18759 758 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W NGR1P32831 672 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W SET4P42948 560 aa7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W DPL1Q05567 589 aa7.2□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W LCB1P25045 558 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W ATG20Q07528 640 aa7.19□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W PIF1P07271 859 aa7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W YGL242CP53066 181 aa7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W RPT4P53549 437 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W SRC1Q03707 834 aa7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W PSF3Q12146 194 aa7.18□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W FPR3P38911 411 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W HAL5P38970 855 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W NCB2Q92317 146 aa7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W AI2P03876 854 aa7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W NOT3P06102 836 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W SQS1P53866 767 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W IRC4Q03036 179 aa7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W GAS5Q08193 484 aa7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W YLR278CQ05854 1341 aa7.16□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W NPL4P33755 580 aa7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W MLC1P53141 149 aa7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIN4YMR138W EPS1P40557 701 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms