RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	CWH41	P53008	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	SRS2	P12954	1174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	PUN1	Q06991	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	SRF1	Q12516	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	TRK1	P12685	1235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	MCM1	P11746	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	AAD14	P42884	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SUM1	P46676	1062 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	YML020W	Q03722	664 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	YJR115W	P47152	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	PNP1	Q05788	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	HAT1	Q12341	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	RRN6	P32786	894 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SLD2	P34252	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	GCR2	Q01722	534 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	NUP85	P46673	744 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	KAR5	Q04746	504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SUV3	P32580	737 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	MSN5	P52918	1224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	LSC2	P53312	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SCD5	P34758	872 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	BRE2	P43132	505 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	SSN3	P39073	555 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	VTC4	P47075	721 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP15	YMR093W	DAL1	P32375	460 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	DLD1	P32891	587 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	YBR197C	P38306	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	BOL3	P39724	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	ATG1	P53104	897 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	HXT5	P38695	592 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	ERP5	P38819	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	YJR098C	P47139	656 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	CAB1	Q04430	367 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	ISC10	P32645	267 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	YTA6	P40328	754 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	JJJ2	P46997	583 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	ACF4	P47129	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	MRPL33	P20084	86 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	SEC20	P28791	383 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	IRE1	P32361	1115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	QDR1	P40475	563 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	SPR3	P41901	512 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	SLA1	P32790	1244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	MDJ2	P42834	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	APC11	Q12157	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTP15	YMR093W	MLF3	P32047	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	UBP15	P50101	1230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YNL165W	P53891	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	OPT2	Q06593	877 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	VMA3	P25515	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	HEM3	P28789	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	LDH1	P38139	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	DYS1	P38791	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	KAP122	P32767	1081 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YBR287W	P38355	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YHL050C	P38721	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YHR219W	P38900	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	SCW11	P53189	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	UFD2	P54860	961 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	PPX1	P38698	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	OSH7	P38755	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	QDR2	P40474	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	PSH1	Q12161	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	MET22	P32179	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	SMC1	P32908	1225 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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