RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W CSC1Q06538 782 aa8.6□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W SNT2P53127 1403 aa8.6□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W ENO1P00924 437 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W NOP2P40991 618 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W MRX10Q05648 414 aa8.59□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W ULS1Q08562 1619 aa8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SSB1P11484 613 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W ARG8P18544 423 aa8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SCJ1P25303 377 aa8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W ERP5P38819 212 aa8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SSB2P40150 613 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YPR109WQ06104 294 aa8.58□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W TGL4P36165 910 aa8.57□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SLI15P38283 698 aa8.57□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W VTH1P40438 1549 aa8.57□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W VTH2P40890 1549 aa8.57□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W ATE1P16639 503 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SIT4P20604 311 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YJU3P28321 313 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W TPM2P40414 161 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W NMA111P53920 997 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W DPL1Q05567 589 aa8.56□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W THI12P42883 340 aa8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W THI5P43534 340 aa8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W THI11P47183 340 aa8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W ALG12P53730 551 aa8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W POB3Q04636 552 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W THI13Q07748 340 aa8.55□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W PDR10P51533 1564 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SEC8P32855 1065 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YHL050CP38721 697 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YHR219WP38900 624 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W RIM21P48565 533 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.54□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W MGE1P38523 228 aa8.53□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W SMC4Q12267 1418 aa8.53□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W DNF3Q12674 1656 aa8.53□□□□□ -1.04
YHC3YJL059W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W YPP1P46951 817 aa8.52□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W KAR5Q04746 504 aa8.52□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W TFB4Q12004 338 aa8.52□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W PPX1P38698 397 aa8.51□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W RSC30P38781 883 aa8.51□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W VAC8P39968 578 aa8.5□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W KRI1P42846 591 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W TY4A-JP47023 414 aa8.5□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W KIP3P53086 805 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W YOL057WQ08225 711 aa8.5□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W CIT2P08679 460 aa8.49□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W SRC1Q03707 834 aa8.49□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W PEP12P32854 288 aa8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W GRS1P38088 690 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05not detected
YHC3YJL059W ECM23Q02710 187 aa8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W ISU2Q12056 156 aa8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W MYO4P32492 1471 aa8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W IQG1Q12280 1495 aa8.48□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W YGL081WP53156 320 aa8.47□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YHC3YJL059W NAF1P53919 492 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W MAK10Q02197 733 aa8.46□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W STB3Q12427 513 aa8.46□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W GAL11P19659 1081 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W SLY41P22215 453 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W PEX21P50091 288 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YDL121CQ07541 149 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W WHI5Q12416 295 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YGR161W-CQ3E744 92 aa8.45□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W GDB1Q06625 1536 aa8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W MDJ2P42834 146 aa8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YJL049WP47048 450 aa8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YOR1P53049 1477 aa8.44□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W TRL1P09880 827 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W RAM1P22007 431 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W GRX4P32642 244 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W MET1P36150 593 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W AIM21P40563 679 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W MAD1P40957 749 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W IOC3P43596 787 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YJR107WP47145 328 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W BNR1P40450 1375 aa8.43□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W TOA1P32773 286 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W GRX7P38068 203 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YAP3P38749 330 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W ERP2P39704 215 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.42□□□□□ -1.06not detected
YHC3YJL059W RTF1P53064 558 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YNL115CP53925 644 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W ALD3P54114 506 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.2 ms