RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeastyeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1YGL196W AIM44Q99299 758 aa7.17□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W STM1P39015 273 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W ECM23Q02710 187 aa7.16□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W FRA1Q07825 749 aa7.16□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W CDC19P00549 500 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W GUT2P32191 649 aa7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W FBP26P32604 452 aa7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W EMP47P43555 445 aa7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W DPH6Q12429 685 aa7.15□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W BDS1Q08347 646 aa7.14□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W STE6P12866 1290 aa7.13□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W PHO87P25360 923 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W SEC20P28791 383 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W ISF1P32488 338 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W ICP55P40051 511 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W KTR7P40504 517 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W JJJ3P47138 172 aa7.12□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W ASF1P32447 279 aa7.11□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W MDJ1P35191 511 aa7.11□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W UBX7P38349 436 aa7.11□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W APL6P46682 809 aa7.11□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W HAP4P14064 554 aa7.1□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W LYS5P50113 272 aa7.1□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W YBL113CQ7M4S9 792 aa7.09□□□□□ -1.27
DSD1YGL196W RRN6P32786 894 aa7.07□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W VTC4P47075 721 aa7.07□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W PAM1P37304 830 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ERP5P38819 212 aa7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ISU1Q03020 165 aa7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W GAS4Q08271 471 aa7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W SOH1P38633 127 aa7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ACS2P52910 683 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W KAR5Q04746 504 aa7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ATG20Q07528 640 aa7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W TSC13Q99190 310 aa7.05□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W TRL1P09880 827 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W CUZ1P53899 274 aa7.04□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W PHM7Q12252 991 aa7.04□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W SRS2P12954 1174 aa7.03□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W IPL1P38991 367 aa7.03□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W YFL034WP43564 1073 aa7.03□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W ROM1P53046 1155 aa7.03□□□□□ -1.28
DSD1YGL196W MET10P39692 1035 aa7.02□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W YFL066CP43538 392 aa7.02□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W DAL1P32375 460 aa7.01□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W PPX1P38698 397 aa7.01□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W ATG1P53104 897 aa7.01□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W NSG2P53898 299 aa7.01□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W PNP1Q05788 311 aa7.01□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W VAN1P23642 535 aa7□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W MDJ2P42834 146 aa7□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W YHL050CP38721 697 aa6.99□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W YHR219WP38900 624 aa6.99□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W ACF4P47129 309 aa6.99□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W PUN1Q06991 263 aa6.99□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W TRS33Q99394 268 aa6.98□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W FUR4P05316 633 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W GRS1P38088 690 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W THI72Q08579 599 aa6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W TY1A-DR3Q12441 440 aa6.97□□□□□ -1.29
DSD1YGL196W SLA1P32790 1244 aa6.96□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W CEM1P39525 442 aa6.96□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W BOL3P39724 118 aa6.96□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W SVF1Q05515 481 aa6.96□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.96□□□□□ -1.3not detected
DSD1YGL196W UBP1P25037 809 aa6.95□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W SSN3P39073 555 aa6.95□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W WTM2Q12206 467 aa6.95□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W AI1P03875 834 aa6.94□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W POL32P47110 350 aa6.94□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W LSO1Q3E827 93 aa6.94□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W UBP15P50101 1230 aa6.93□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W CWH41P53008 833 aa6.93□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W HDA3Q06623 655 aa6.93□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W SYT1Q06836 1226 aa6.93□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W QDR1P40475 563 aa6.92□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W ALD2P47771 506 aa6.92□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W DIT1P21623 536 aa6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W NTH2P35172 780 aa6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W GLO3P38682 493 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W MSN5P52918 1224 aa6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
DSD1YGL196W NUT2Q06213 157 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms