RNA–Protein interactions for RNA: YOL056W

GPM3, Transcript of Homolog of Gpm1p phosphoglycerate mutase, yeast

Gene GPM3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPM3	YOL056W	PRM15	Q03262	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	VBA1	Q04301	562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GPM3	YOL056W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
GPM3	YOL056W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CDC43	P18898	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MDH2	P22133	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ACB1	P31787	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CIN2	P46670	268 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ORM2	Q06144	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FEX1	Q08913	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YLR415C	O13578	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	IFM1	P25038	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CPR4	P25334	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SUA5	P32579	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YBL010C	P32788	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MRPL39	P36533	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	LAG1	P38703	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PHM8	P40025	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	OTU1	P43558	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	IKS1	P47042	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	NIT3	P49954	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	AVT4	P50944	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YIP4	P53093	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RNH201	P53942	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	GAS2	Q06135	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MCT1	Q12283	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ISA2	Q12425	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PHO2	P07269	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RIP1	P08067	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	VMA7	P39111	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YIL060W	P40519	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	CTK2	P46962	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YGL159W	P53110	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FMP48	P53233	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PCP1	P53259	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YML018C	Q03730	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	COA4	Q05809	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HEM25	Q07534	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	TMS1	Q12116	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PET20	Q99373	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	BLM10	P43583	2143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PUT1	P09368	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SEN2	P16658	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YCR101C	P25607	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ERG3	P32353	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YPC1	P38298	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	BUD8	P41698	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	MOB2	P43563	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	PHB2	P50085	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ATG4	P53867	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	HHT1	P61830	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	BUD25	P85052	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	COQ11	Q05892	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	RFU1	Q08003	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	SCP1	Q08873	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	FEX2	Q08991	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	VAM3	Q12241	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	BBP1	Q12365	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	ATG31	Q12421	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPM3	YOL056W	IZH2	Q12442	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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