RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	YCR015C	P25616	317 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MIG1	P27705	504 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	OCH1	P31755	480 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NTH1	P32356	751 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	EMP70	P32802	667 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	DCW1	P36091	449 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRPS9	P38120	278 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	DOG2	P38773	246 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NDT80	P38830	627 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YHR210C	P38893	341 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YJR015W	P47090	510 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YGR149W	P48236	432 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YGL235W	P53071	178 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YIP4	P53093	235 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NSG2	P53898	299 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLR346C	Q06139	101 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	AAD4	Q07747	329 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IRC13	Q08630	104 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YCT1	Q12235	531 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GEP5	Q12393	293 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IZH4	Q99393	312 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRP49	P32388	137 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LDH1	P38139	375 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SRP14	P38985	146 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SPC25	P40014	221 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SHO1	P40073	367 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	VNX1	P42839	908 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PET130	P47065	347 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MUP1	P50276	574 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YIP3	P53633	176 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	DPP1	Q05521	289 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LOA1	Q06508	300 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GPB1	Q08886	897 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BTS1	Q12051	335 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	WTM2	Q12206	467 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	COX19	Q3E731	98 aa		3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
XRS2	YDR369C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	COX13	P32799	129 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SCD5	P34758	872 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	EAF5	P39995	279 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SHR5	P41912	237 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RPA43	P46669	326 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	AVT1	P47082	602 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	BNS1	P50084	137 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	APS2	Q00381	147 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	EST3	Q03096	181 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TMA23	Q03525	211 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CAB5	Q03941	241 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MRX8	Q05473	314 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PLB3	Q08108	686 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TMS1	Q12116	473 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RIF1	P29539	1916 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YKL187C	P34231	750 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YKL102C	P34249	101 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MTH1	P35198	433 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DAD2	P36162	133 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YMC2	P38087	329 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TAE1	P38340	232 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YCH1	P42937	148 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PAU5	P43575	122 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	COX18	P53239	316 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SWM1	Q12379	170 aa		3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HTA2	P04912	132 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YCR007C	P25354	239 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DOG1	P38774	246 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	AYR1	P40471	297 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	POP1	P41812	875 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ULI1	P43604	169 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TYW3	P53177	273 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RTT102	P53330	157 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RNH201	P53942	307 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CDC14	Q00684	551 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.26	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	AIM33	Q04516	312 aa		3.26	□□□□□ -1.89

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