RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W GPX2P38143 162 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RIB5P38145 238 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W BMT2P38278 337 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YAT2P40017 923 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SIM1P40472 476 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W BMT5P40493 336 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CPR7P47103 393 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PRP24P49960 444 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MGA1P53050 456 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NIF3P53081 288 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W IBD2P53892 351 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SWS2P53937 143 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YMR010WQ03687 405 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TRM82Q03774 444 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W BNA5Q05979 453 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SFH1Q06168 426 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TPO3Q06451 622 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YLR012CQ07927 99 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GAT3Q07928 141 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ESA1Q08649 445 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YPL199CQ08954 240 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YPL278CQ08990 100 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CSF1Q12150 2958 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CAP2P13517 287 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SEN2P16658 377 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YCR102CP25608 368 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W QRI5P32344 111 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NUF2P33895 451 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YKL187CP34231 750 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SDS24P38314 527 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YER184CP39961 794 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SMB1P40018 196 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YER121WP40076 114 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W IRC7P43623 340 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CIN2P46670 268 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W IRC18P47056 224 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GTR2P53290 341 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MAL13P53338 473 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YNL140CP53910 189 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YMR027WQ04371 470 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YML096WQ04489 525 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W THI20Q08224 551 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YPL150WQ12152 901 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TFC7Q12415 435 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NAG1Q8TGN9 163 aa3.6□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PUT1P09368 476 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ERD1P16151 362 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MCH2P36032 473 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CHK1P38147 527 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YKE4P40544 346 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GDS1P41913 522 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PMT4P46971 762 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CIS3P47001 227 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NUP57P48837 541 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MTM1P53320 366 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YPL113CQ02961 396 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TAF9Q05027 157 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YDL009CQ12210 107 aa3.59□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YBR056W-AI2HB52 66 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W PET494P07390 489 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W URA6P15700 204 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W HEM15P16622 393 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W INO2P26798 304 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W EHD3P28817 500 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W JEN1P36035 616 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W VMA22P38784 181 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W YFR057WP43625 151 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W UBC13P52490 153 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W BRR6P53062 197 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W YGR042WP53227 271 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W FYV6P53913 173 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W BCH1Q05029 724 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W MFG1Q07684 458 aa3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W REP1P03871 373 aa3.57□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PIR3YKL163W YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms