Protein–RNA interactions for Protein: P40018

SMB1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMB1P40018 NSR1YGR159C 1245 nt17.71■□□□□ 0.43
SMB1P40018 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.5■□□□□ 0.39
SMB1P40018 NOP1YDL014W 984 nt16.9■□□□□ 0.3
SMB1P40018 MDJ1YFL016C 1536 nt16.06■□□□□ 0.16
SMB1P40018 YKL036CYKL036C 393 nt15.17■□□□□ 0.02
SMB1P40018 YJL027CYJL027C 417 nt14.85□□□□□ -0.03
SMB1P40018 SRX1YKL086W 384 nt14.69□□□□□ -0.06
SMB1P40018 Q0297Q0297 156 nt14.58□□□□□ -0.08
SMB1P40018 DBP2YNL112W 1641 nt13.98□□□□□ -0.17
SMB1P40018 YCR051WYCR051W 669 nt13.95□□□□□ -0.18
SMB1P40018 YBR190WYBR190W 312 nt13.82□□□□□ -0.2
SMB1P40018 SCS3YGL126W 1143 nt13.57□□□□□ -0.24
SMB1P40018 RTC3YHR087W 336 nt13.56□□□□□ -0.24
SMB1P40018 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SMB1P40018 CCC1YLR220W 969 nt13.41□□□□□ -0.26
SMB1P40018 RVS167YDR388W 1449 nt13.24□□□□□ -0.29
SMB1P40018 YOL085CYOL085C 342 nt13.11□□□□□ -0.31
SMB1P40018 RPP1BYDL130W 321 nt13.09□□□□□ -0.31
SMB1P40018 PKP1YIL042C 1185 nt12.97□□□□□ -0.33
SMB1P40018 SCJ1YMR214W 1134 nt12.94□□□□□ -0.34
SMB1P40018 SSA3YBL075C 1950 nt12.86□□□□□ -0.35
SMB1P40018 PUT4YOR348C 1884 nt12.79□□□□□ -0.36
SMB1P40018 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.64□□□□□ -0.39
SMB1P40018 SHR5YOL110W 714 nt12.62□□□□□ -0.39
SMB1P40018 PET122YER153C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
SMB1P40018 URN1YPR152C 1398 nt12.5□□□□□ -0.41
SMB1P40018 ARE1YCR048W 1833 nt12.45□□□□□ -0.42
SMB1P40018 SCR1SCR1 522 nt12.4□□□□□ -0.42
SMB1P40018 POA1YBR022W 534 nt12.4□□□□□ -0.42
SMB1P40018 SAH1YER043C 1350 nt12.4□□□□□ -0.42
SMB1P40018 DEP1YAL013W 1218 nt12.37□□□□□ -0.43
SMB1P40018 OPI9YLR338W 858 nt12.37□□□□□ -0.43
SMB1P40018 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.34□□□□□ -0.43
SMB1P40018 RPN10YHR200W 807 nt12.3□□□□□ -0.44
SMB1P40018 YDJ1YNL064C 1230 nt12.25□□□□□ -0.45
SMB1P40018 BSC6YOL137W 1494 nt12.2□□□□□ -0.46
SMB1P40018 YNL208WYNL208W 600 nt12.16□□□□□ -0.46
SMB1P40018 RRN5YLR141W 1092 nt12.14□□□□□ -0.47
SMB1P40018 BUD23YCR047C 828 nt12.06□□□□□ -0.48
SMB1P40018 PUN1YLR414C 792 nt12.06□□□□□ -0.48
SMB1P40018 GAR1YHR089C 618 nt12.05□□□□□ -0.48
SMB1P40018 ATS1YAL020C 1002 nt12.02□□□□□ -0.49
SMB1P40018 PTC2YER089C 1395 nt11.95□□□□□ -0.5
SMB1P40018 YJR018WYJR018W 363 nt11.9□□□□□ -0.5
SMB1P40018 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.88□□□□□ -0.51
SMB1P40018 NAB2YGL122C 1578 nt11.86□□□□□ -0.51
SMB1P40018 RSB1YOR049C 1065 nt11.82□□□□□ -0.52
SMB1P40018 SPT5YML010W 3192 nt11.79□□□□□ -0.52
SMB1P40018 TIR1YER011W 765 nt11.66□□□□□ -0.54
SMB1P40018 SSA4YER103W 1929 nt11.64□□□□□ -0.55
SMB1P40018 FPR4YLR449W 1179 nt11.64□□□□□ -0.55
SMB1P40018 RPP2BYDR382W 333 nt11.63□□□□□ -0.55
SMB1P40018 DAL1YIR027C 1383 nt11.63□□□□□ -0.55
SMB1P40018 FIS1YIL065C 468 nt11.61□□□□□ -0.55
SMB1P40018 SSA1YAL005C 1929 nt11.55□□□□□ -0.56
SMB1P40018 INM2YDR287W 879 nt11.55□□□□□ -0.56
SMB1P40018 YJR120WYJR120W 351 nt11.52□□□□□ -0.57
SMB1P40018 PHO4YFR034C 939 nt11.5□□□□□ -0.57
SMB1P40018 MEP2YNL142W 1500 nt11.49□□□□□ -0.57
SMB1P40018 YPS1YLR120C 1710 nt11.4□□□□□ -0.58
SMB1P40018 YBL100CYBL100C 315 nt11.37□□□□□ -0.59
SMB1P40018 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.36□□□□□ -0.59
SMB1P40018 YDR095CYDR095C 411 nt11.27□□□□□ -0.61
SMB1P40018 DCW1YKL046C 1350 nt11.27□□□□□ -0.61
SMB1P40018 BDH2YAL061W 1254 nt11.26□□□□□ -0.61
SMB1P40018 FUN26YAL022C 1554 nt11.2□□□□□ -0.62
SMB1P40018 SRB2YHR041C 633 nt11.2□□□□□ -0.62
SMB1P40018 YMR090WYMR090W 684 nt11.2□□□□□ -0.62
SMB1P40018 ALF1YNL148C 765 nt11.2□□□□□ -0.62
SMB1P40018 BDF1YLR399C 2061 nt11.18□□□□□ -0.62
SMB1P40018 PST2YDR032C 597 nt11.17□□□□□ -0.62
SMB1P40018 EMI2YDR516C 1503 nt11.15□□□□□ -0.62
SMB1P40018 TRM9YML014W 840 nt11.15□□□□□ -0.62
SMB1P40018 RPP2AYOL039W 321 nt11.08□□□□□ -0.64
SMB1P40018 WWM1YFL010C 636 nt11.05□□□□□ -0.64
SMB1P40018 TAT1YBR069C 1860 nt11.04□□□□□ -0.64
SMB1P40018 YDL221WYDL221W 552 nt11.04□□□□□ -0.64
SMB1P40018 LSM3YLR438C-A 270 nt11.04□□□□□ -0.64
SMB1P40018 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.03□□□□□ -0.64
SMB1P40018 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.03□□□□□ -0.64
SMB1P40018 YBR220CYBR220C 1683 nt11.03□□□□□ -0.64
SMB1P40018 CCT6YDR188W 1641 nt11.01□□□□□ -0.65
SMB1P40018 PTP1YDL230W 1008 nt10.99□□□□□ -0.65
SMB1P40018 CAC2YML102W 1407 nt10.98□□□□□ -0.65
SMB1P40018 SDH1YKL148C 1923 nt10.97□□□□□ -0.65
SMB1P40018 YGR021WYGR021W 873 nt10.94□□□□□ -0.66
SMB1P40018 SIS1YNL007C 1059 nt10.94□□□□□ -0.66
SMB1P40018 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.92□□□□□ -0.66
SMB1P40018 SCC4YER147C 1875 nt10.87□□□□□ -0.67
SMB1P40018 PAC11YDR488C 1602 nt10.84□□□□□ -0.67
SMB1P40018 IRC15YPL017C 1500 nt10.82□□□□□ -0.68
SMB1P40018 NVJ2YPR091C 2313 nt10.81□□□□□ -0.68
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