Protein–RNA interactions for Protein: P28817

EHD3, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EHD3P28817 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.45■□□□□ 0.54
EHD3P28817 NSR1YGR159C 1245 nt18.32■□□□□ 0.52
EHD3P28817 NOP1YDL014W 984 nt17.97■□□□□ 0.47
EHD3P28817 YKL036CYKL036C 393 nt16.54■□□□□ 0.24
EHD3P28817 MDJ1YFL016C 1536 nt16.24■□□□□ 0.19
EHD3P28817 Q0297Q0297 156 nt15.67■□□□□ 0.1
EHD3P28817 SRX1YKL086W 384 nt15.65■□□□□ 0.1
EHD3P28817 YJL027CYJL027C 417 nt15.46■□□□□ 0.07
EHD3P28817 SCS3YGL126W 1143 nt15.01□□□□□ -0.01
EHD3P28817 YCR051WYCR051W 669 nt14.89□□□□□ -0.03
EHD3P28817 DBP2YNL112W 1641 nt14.33□□□□□ -0.12
EHD3P28817 YOL085CYOL085C 342 nt14.3□□□□□ -0.12
EHD3P28817 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.13□□□□□ -0.15
EHD3P28817 PKP1YIL042C 1185 nt14.1□□□□□ -0.15
EHD3P28817 RPP1BYDL130W 321 nt14.07□□□□□ -0.16
EHD3P28817 CCC1YLR220W 969 nt14.05□□□□□ -0.16
EHD3P28817 YBR190WYBR190W 312 nt13.87□□□□□ -0.19
EHD3P28817 RTC3YHR087W 336 nt13.61□□□□□ -0.23
EHD3P28817 RVS167YDR388W 1449 nt13.59□□□□□ -0.23
EHD3P28817 ATS1YAL020C 1002 nt13.45□□□□□ -0.26
EHD3P28817 PET122YER153C 765 nt13.43□□□□□ -0.26
EHD3P28817 SCJ1YMR214W 1134 nt13.4□□□□□ -0.26
EHD3P28817 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.39□□□□□ -0.27
EHD3P28817 SCR1SCR1 522 nt13.36□□□□□ -0.27
EHD3P28817 SSA3YBL075C 1950 nt13.22□□□□□ -0.29
EHD3P28817 SHR5YOL110W 714 nt13.07□□□□□ -0.32
EHD3P28817 RRN5YLR141W 1092 nt13.06□□□□□ -0.32
EHD3P28817 YDJ1YNL064C 1230 nt12.95□□□□□ -0.34
EHD3P28817 RSB1YOR049C 1065 nt12.82□□□□□ -0.36
EHD3P28817 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.79□□□□□ -0.36
EHD3P28817 URN1YPR152C 1398 nt12.7□□□□□ -0.38
EHD3P28817 DEP1YAL013W 1218 nt12.7□□□□□ -0.38
EHD3P28817 GAR1YHR089C 618 nt12.68□□□□□ -0.38
EHD3P28817 RPN10YHR200W 807 nt12.56□□□□□ -0.4
EHD3P28817 PUT4YOR348C 1884 nt12.55□□□□□ -0.4
EHD3P28817 OPI9YLR338W 858 nt12.51□□□□□ -0.41
EHD3P28817 YNL208WYNL208W 600 nt12.51□□□□□ -0.41
EHD3P28817 PST2YDR032C 597 nt12.43□□□□□ -0.42
EHD3P28817 SAH1YER043C 1350 nt12.43□□□□□ -0.42
EHD3P28817 ARE1YCR048W 1833 nt12.33□□□□□ -0.44
EHD3P28817 TIR1YER011W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
EHD3P28817 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.2□□□□□ -0.46
EHD3P28817 POA1YBR022W 534 nt12.2□□□□□ -0.46
EHD3P28817 PUN1YLR414C 792 nt12.17□□□□□ -0.46
EHD3P28817 YJR018WYJR018W 363 nt12.13□□□□□ -0.47
EHD3P28817 SSA1YAL005C 1929 nt12.07□□□□□ -0.48
EHD3P28817 PTC2YER089C 1395 nt12.01□□□□□ -0.49
EHD3P28817 YKL097CYKL097C 411 nt11.99□□□□□ -0.49
EHD3P28817 BUD23YCR047C 828 nt11.96□□□□□ -0.49
EHD3P28817 RPP2BYDR382W 333 nt11.93□□□□□ -0.5
EHD3P28817 SHU1YHL006C 453 nt11.93□□□□□ -0.5
EHD3P28817 BSC6YOL137W 1494 nt11.91□□□□□ -0.5
EHD3P28817 NAB2YGL122C 1578 nt11.86□□□□□ -0.51
EHD3P28817 YJR120WYJR120W 351 nt11.84□□□□□ -0.51
EHD3P28817 SRB2YHR041C 633 nt11.8□□□□□ -0.52
EHD3P28817 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.77□□□□□ -0.53
EHD3P28817 FPR4YLR449W 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
EHD3P28817 INM2YDR287W 879 nt11.71□□□□□ -0.53
EHD3P28817 DAL1YIR027C 1383 nt11.7□□□□□ -0.54
EHD3P28817 WWM1YFL010C 636 nt11.7□□□□□ -0.54
EHD3P28817 YGR021WYGR021W 873 nt11.67□□□□□ -0.54
EHD3P28817 BDH2YAL061W 1254 nt11.64□□□□□ -0.55
EHD3P28817 FIS1YIL065C 468 nt11.63□□□□□ -0.55
EHD3P28817 YBL100CYBL100C 315 nt11.59□□□□□ -0.55
EHD3P28817 PHO4YFR034C 939 nt11.57□□□□□ -0.56
EHD3P28817 HOM6YJR139C 1080 nt11.57□□□□□ -0.56
EHD3P28817 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.52□□□□□ -0.57
EHD3P28817 MNP1YGL068W 585 nt11.52□□□□□ -0.57
EHD3P28817 LSM3YLR438C-A 270 nt11.49□□□□□ -0.57
EHD3P28817 TRM9YML014W 840 nt11.46□□□□□ -0.57
EHD3P28817 NPL3YDR432W 1245 nt11.44□□□□□ -0.58
EHD3P28817 YOR139CYOR139C 393 nt11.44□□□□□ -0.58
EHD3P28817 SSA4YER103W 1929 nt11.44□□□□□ -0.58
EHD3P28817 FUN26YAL022C 1554 nt11.44□□□□□ -0.58
EHD3P28817 RKM5YLR137W 1104 nt11.41□□□□□ -0.58
EHD3P28817 SPT5YML010W 3192 nt11.4□□□□□ -0.58
EHD3P28817 YOL037CYOL037C 354 nt11.35□□□□□ -0.59
EHD3P28817 YPS1YLR120C 1710 nt11.33□□□□□ -0.6
EHD3P28817 ALF1YNL148C 765 nt11.33□□□□□ -0.6
EHD3P28817 CCT6YDR188W 1641 nt11.29□□□□□ -0.6
EHD3P28817 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.26□□□□□ -0.61
EHD3P28817 YDR095CYDR095C 411 nt11.25□□□□□ -0.61
EHD3P28817 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.25□□□□□ -0.61
EHD3P28817 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.25□□□□□ -0.61
EHD3P28817 MEP2YNL142W 1500 nt11.18□□□□□ -0.62
EHD3P28817 PAC11YDR488C 1602 nt11.13□□□□□ -0.63
EHD3P28817 SIS1YNL007C 1059 nt11.09□□□□□ -0.63
EHD3P28817 BDF1YLR399C 2061 nt11.08□□□□□ -0.63
EHD3P28817 RPP2AYOL039W 321 nt11.08□□□□□ -0.64
EHD3P28817 YLR281CYLR281C 468 nt11.07□□□□□ -0.64
EHD3P28817 WHI5YOR083W 888 nt11.06□□□□□ -0.64
EHD3P28817 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.03□□□□□ -0.64
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