RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W COQ5P49017 307 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TOS2P50078 622 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SWC4P53201 476 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SEC10Q06245 871 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MHR1Q06630 226 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W JLP1Q12358 412 aa3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YDR157WA0A023PZE8 133 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NAM2P11325 894 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ECM15P35195 104 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W FRE2P36033 711 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ECM13P38195 257 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GIM4P40005 111 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YJR030CP47101 745 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MRM2P53123 320 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YIP3P53633 176 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TIM8P57744 87 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ECM11Q04110 302 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W DIC1Q06143 298 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TIM18Q08749 192 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YDL109CQ12103 647 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TMS1Q12116 473 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SLY1P22213 666 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PTP1P25044 335 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W KAR9P32526 644 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TIR2P33890 251 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YOX1P34161 385 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PHD1P36093 366 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ECM8P38246 354 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SHG1P38337 142 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SOK1P40317 901 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W XBP1P40489 647 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W DFG10P40526 253 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GAB1P41733 394 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TIS11P47977 285 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MIC26P50087 233 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W USE1P53146 245 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MST27P53176 234 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NRM1P53718 249 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YNL234WP53857 426 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NUP100Q02629 959 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W IRC15Q02733 499 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ODC1Q03028 310 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PIR3Q03180 325 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SNX41Q04053 625 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W GRE1Q08969 168 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YCL012CQ8J0M4 134 aa3.63□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W AQY1P0CD91 305 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CAF4P36130 643 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SEO1P39709 593 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YIL169CP40442 995 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SER33P40510 469 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YNL320WP42840 284 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YCH1P42937 148 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SFH5P47008 294 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W AIM23P47015 356 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YJL016WP47072 561 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YJR079WP47126 109 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YNL095CP53932 642 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ASI3P53983 676 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CCE1Q03702 353 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W HEM25Q07534 307 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W NDD1Q08887 554 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YOR114WQ12219 294 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YCT1Q12235 531 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W DCN1Q12395 269 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W YPR064WQ12492 139 aa3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TFS1P14306 219 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CTA1P15202 515 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W CDC10P25342 322 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W POF1P25576 258 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W MEI4P29467 408 aa3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TRR1P29509 319 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PIR3YKL163W PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms