RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W MDM32Q12171 622 aa3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YDR018CQ12185 396 aa3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W JLP1Q12358 412 aa3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TRM10Q12400 293 aa3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PRM4Q12498 284 aa3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
VFA1YER128W VTH1P40438 1549 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W VTH2P40890 1549 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W COX5BP00425 151 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CAP2P13517 287 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SAG1P20840 650 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YCR023CP25351 611 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MSK1P32048 576 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HXT4P32467 576 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YKL162CP36052 402 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YBR013CP38215 129 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PPE1P38796 400 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W IKI1P38874 309 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W AXL2P38928 823 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W OXA1P39952 402 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SMB1P40018 196 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ERG28P40030 148 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W COG3P40094 801 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ASG7P46993 209 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SFH5P47008 294 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W STD1Q02794 444 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DPP1Q05521 289 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CNL1Q06333 122 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ATG10Q07879 167 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PER33Q12144 273 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CRC1Q12289 327 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TFC7Q12415 435 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RMD5Q12508 421 aa3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W BAR1P12630 587 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HAP3P13434 144 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W EXO70P19658 623 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YCR061WP25639 631 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W FRE1P32791 686 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PDC2P32896 925 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PHD1P36093 366 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TUL1P36096 758 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DRE2P36152 348 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YKR075CP36155 307 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MBA1P38300 278 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W LAG1P38703 411 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PFS1P38872 237 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CKB2P38930 258 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PHO90P39535 881 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HEM14P40012 539 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W KRE29P40026 464 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SLZ1P40167 298 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YNL320WP42840 284 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HOC1P47124 396 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W EFM3P47163 339 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YGL185CP53100 379 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W POP6P53218 158 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YNL143CP53908 130 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YLR460CP54007 376 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W UBC7Q02159 165 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W FMN1Q03778 218 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YET2Q04210 160 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SHH3Q04487 196 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RRG8Q06109 277 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W NBP2Q12163 236 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YOL114CQ12322 202 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RKM5Q12367 367 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YDL199CQ12407 687 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PCC1Q3E833 88 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RHO1P06780 209 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RHO2P06781 192 aa3.12□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PUT1P09368 476 aa3.12□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ART10P18634 518 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DAL82P21705 255 aa3.12□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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