Protein–RNA interactions for Protein: P40030

ERG28, Ergosterol biosynthetic protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ERG28P40030 NSR1YGR159C 1245 nt14.46□□□□□ -0.09
ERG28P40030 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.34□□□□□ -0.11
ERG28P40030 NOP1YDL014W 984 nt13.95□□□□□ -0.18
ERG28P40030 MDJ1YFL016C 1536 nt12.93□□□□□ -0.34
ERG28P40030 YKL036CYKL036C 393 nt12.61□□□□□ -0.39
ERG28P40030 SRX1YKL086W 384 nt12.11□□□□□ -0.47
ERG28P40030 Q0297Q0297 156 nt12.06□□□□□ -0.48
ERG28P40030 YJL027CYJL027C 417 nt12.03□□□□□ -0.48
ERG28P40030 SSA3YBL075C 1950 nt11.64□□□□□ -0.55
ERG28P40030 YCR051WYCR051W 669 nt11.5□□□□□ -0.57
ERG28P40030 DBP2YNL112W 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
ERG28P40030 SCS3YGL126W 1143 nt11.29□□□□□ -0.6
ERG28P40030 YBR190WYBR190W 312 nt11.17□□□□□ -0.62
ERG28P40030 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.03□□□□□ -0.64
ERG28P40030 CCC1YLR220W 969 nt10.95□□□□□ -0.66
ERG28P40030 RTC3YHR087W 336 nt10.94□□□□□ -0.66
ERG28P40030 YOL085CYOL085C 342 nt10.88□□□□□ -0.67
ERG28P40030 RPP1BYDL130W 321 nt10.83□□□□□ -0.68
ERG28P40030 SSA1YAL005C 1929 nt10.8□□□□□ -0.68
ERG28P40030 RVS167YDR388W 1449 nt10.79□□□□□ -0.68
ERG28P40030 Q0182Q0182 405 nt10.77□□□□□ -0.69
ERG28P40030 PKP1YIL042C 1185 nt10.71□□□□□ -0.69
ERG28P40030 FPS1YLL043W 2010 nt10.6□□□□□ -0.71
ERG28P40030 SCJ1YMR214W 1134 nt10.49□□□□□ -0.73
ERG28P40030 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.38□□□□□ -0.75
ERG28P40030 NVJ2YPR091C 2313 nt10.35□□□□□ -0.75
ERG28P40030 PET122YER153C 765 nt10.32□□□□□ -0.76
ERG28P40030 SHR5YOL110W 714 nt10.29□□□□□ -0.76
ERG28P40030 SCR1SCR1 522 nt10.28□□□□□ -0.76
ERG28P40030 PUT4YOR348C 1884 nt10.19□□□□□ -0.78
ERG28P40030 PAC11YDR488C 1602 nt10.15□□□□□ -0.79
ERG28P40030 URN1YPR152C 1398 nt10.12□□□□□ -0.79
ERG28P40030 YDJ1YNL064C 1230 nt10.08□□□□□ -0.8
ERG28P40030 ATS1YAL020C 1002 nt10.07□□□□□ -0.8
ERG28P40030 RPN10YHR200W 807 nt10.03□□□□□ -0.8
ERG28P40030 DEP1YAL013W 1218 nt10.02□□□□□ -0.81
ERG28P40030 RRN5YLR141W 1092 nt10.02□□□□□ -0.81
ERG28P40030 OPI9YLR338W 858 nt10.01□□□□□ -0.81
ERG28P40030 SAH1YER043C 1350 nt9.97□□□□□ -0.81
ERG28P40030 ARE1YCR048W 1833 nt9.94□□□□□ -0.82
ERG28P40030 MOT3YMR070W 1473 nt9.91□□□□□ -0.82
ERG28P40030 YNL208WYNL208W 600 nt9.91□□□□□ -0.82
ERG28P40030 POA1YBR022W 534 nt9.9□□□□□ -0.82
ERG28P40030 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.87□□□□□ -0.83
ERG28P40030 GAR1YHR089C 618 nt9.86□□□□□ -0.83
ERG28P40030 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.8□□□□□ -0.84
ERG28P40030 RSB1YOR049C 1065 nt9.79□□□□□ -0.84
ERG28P40030 PUN1YLR414C 792 nt9.77□□□□□ -0.85
ERG28P40030 BSC6YOL137W 1494 nt9.72□□□□□ -0.85
ERG28P40030 BUD23YCR047C 828 nt9.67□□□□□ -0.86
ERG28P40030 YJR018WYJR018W 363 nt9.66□□□□□ -0.86
ERG28P40030 PTC2YER089C 1395 nt9.63□□□□□ -0.87
ERG28P40030 NAB2YGL122C 1578 nt9.57□□□□□ -0.88
ERG28P40030 TIR1YER011W 765 nt9.55□□□□□ -0.88
ERG28P40030 RPM1RPM1 483 nt9.54□□□□□ -0.88
ERG28P40030 RPP2BYDR382W 333 nt9.49□□□□□ -0.89
ERG28P40030 UME6YDR207C 2511 nt9.47□□□□□ -0.89
ERG28P40030 DAL1YIR027C 1383 nt9.39□□□□□ -0.91
ERG28P40030 INM2YDR287W 879 nt9.39□□□□□ -0.91
ERG28P40030 FPR4YLR449W 1179 nt9.39□□□□□ -0.91
ERG28P40030 SSA4YER103W 1929 nt9.34□□□□□ -0.91
ERG28P40030 PST2YDR032C 597 nt9.33□□□□□ -0.92
ERG28P40030 FIS1YIL065C 468 nt9.31□□□□□ -0.92
ERG28P40030 YJR120WYJR120W 351 nt9.31□□□□□ -0.92
ERG28P40030 PHO4YFR034C 939 nt9.27□□□□□ -0.93
ERG28P40030 SPT5YML010W 3192 nt9.25□□□□□ -0.93
ERG28P40030 BDF1YLR399C 2061 nt9.23□□□□□ -0.93
ERG28P40030 YBL100CYBL100C 315 nt9.22□□□□□ -0.93
ERG28P40030 BDH2YAL061W 1254 nt9.19□□□□□ -0.94
ERG28P40030 MEP2YNL142W 1500 nt9.15□□□□□ -0.94
ERG28P40030 YPS1YLR120C 1710 nt9.15□□□□□ -0.94
ERG28P40030 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.13□□□□□ -0.95
ERG28P40030 SRB2YHR041C 633 nt9.09□□□□□ -0.95
ERG28P40030 TRM9YML014W 840 nt9.09□□□□□ -0.95
ERG28P40030 FRE6YLL051C 2139 nt9.08□□□□□ -0.96
ERG28P40030 FUN26YAL022C 1554 nt9.08□□□□□ -0.96
ERG28P40030 ALF1YNL148C 765 nt9.08□□□□□ -0.96
ERG28P40030 YDR095CYDR095C 411 nt9.07□□□□□ -0.96
ERG28P40030 LSM3YLR438C-A 270 nt9.06□□□□□ -0.96
ERG28P40030 TAT1YBR069C 1860 nt9.06□□□□□ -0.96
ERG28P40030 WWM1YFL010C 636 nt9.05□□□□□ -0.96
ERG28P40030 YGR021WYGR021W 873 nt9.04□□□□□ -0.96
ERG28P40030 SHU1YHL006C 453 nt8.99□□□□□ -0.97
ERG28P40030 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt8.98□□□□□ -0.97
ERG28P40030 SUF2tP(AGG)C 72 nt8.98□□□□□ -0.97
ERG28P40030 SUF10tP(AGG)N 72 nt8.98□□□□□ -0.97
ERG28P40030 YMR090WYMR090W 684 nt8.98□□□□□ -0.97
ERG28P40030 CCT6YDR188W 1641 nt8.95□□□□□ -0.98
ERG28P40030 DCW1YKL046C 1350 nt8.95□□□□□ -0.98
ERG28P40030 RPP2AYOL039W 321 nt8.93□□□□□ -0.98
ERG28P40030 YKL097CYKL097C 411 nt8.92□□□□□ -0.98
ERG28P40030 HOM6YJR139C 1080 nt8.9□□□□□ -0.98
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