Protein–RNA interactions for Protein: Q12024

YTM1, Ribosome biogenesis protein YTM1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTM1Q12024 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.19■□□□□ 0.66
YTM1Q12024 NSR1YGR159C 1245 nt19.11■□□□□ 0.65
YTM1Q12024 NOP1YDL014W 984 nt18.7■□□□□ 0.58
YTM1Q12024 YKL036CYKL036C 393 nt17.18■□□□□ 0.34
YTM1Q12024 MDJ1YFL016C 1536 nt16.95■□□□□ 0.3
YTM1Q12024 Q0297Q0297 156 nt16.31■□□□□ 0.2
YTM1Q12024 SRX1YKL086W 384 nt16.29■□□□□ 0.2
YTM1Q12024 YJL027CYJL027C 417 nt16.04■□□□□ 0.16
YTM1Q12024 SCS3YGL126W 1143 nt15.59■□□□□ 0.09
YTM1Q12024 YCR051WYCR051W 669 nt15.45■□□□□ 0.06
YTM1Q12024 DBP2YNL112W 1641 nt14.95□□□□□ -0.02
YTM1Q12024 YOL085CYOL085C 342 nt14.85□□□□□ -0.03
YTM1Q12024 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YTM1Q12024 RPP1BYDL130W 321 nt14.64□□□□□ -0.07
YTM1Q12024 PKP1YIL042C 1185 nt14.61□□□□□ -0.07
YTM1Q12024 CCC1YLR220W 969 nt14.58□□□□□ -0.08
YTM1Q12024 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
YTM1Q12024 RVS167YDR388W 1449 nt14.19□□□□□ -0.14
YTM1Q12024 RTC3YHR087W 336 nt14.19□□□□□ -0.14
YTM1Q12024 SCJ1YMR214W 1134 nt13.99□□□□□ -0.17
YTM1Q12024 PET122YER153C 765 nt13.95□□□□□ -0.18
YTM1Q12024 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.93□□□□□ -0.18
YTM1Q12024 ATS1YAL020C 1002 nt13.93□□□□□ -0.18
YTM1Q12024 SCR1SCR1 522 nt13.88□□□□□ -0.19
YTM1Q12024 Q0182Q0182 405 nt13.84□□□□□ -0.19
YTM1Q12024 SHR5YOL110W 714 nt13.64□□□□□ -0.23
YTM1Q12024 RRN5YLR141W 1092 nt13.55□□□□□ -0.24
YTM1Q12024 YDJ1YNL064C 1230 nt13.5□□□□□ -0.25
YTM1Q12024 PUT4YOR348C 1884 nt13.48□□□□□ -0.25
YTM1Q12024 SSA3YBL075C 1950 nt13.38□□□□□ -0.27
YTM1Q12024 MOT3YMR070W 1473 nt13.32□□□□□ -0.28
YTM1Q12024 RSB1YOR049C 1065 nt13.3□□□□□ -0.28
YTM1Q12024 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.29□□□□□ -0.28
YTM1Q12024 URN1YPR152C 1398 nt13.25□□□□□ -0.29
YTM1Q12024 DEP1YAL013W 1218 nt13.21□□□□□ -0.29
YTM1Q12024 GAR1YHR089C 618 nt13.18□□□□□ -0.3
YTM1Q12024 ARE1YCR048W 1833 nt13.13□□□□□ -0.31
YTM1Q12024 RPN10YHR200W 807 nt13.12□□□□□ -0.31
YTM1Q12024 OPI9YLR338W 858 nt13.06□□□□□ -0.32
YTM1Q12024 YNL208WYNL208W 600 nt13.06□□□□□ -0.32
YTM1Q12024 SAH1YER043C 1350 nt13.05□□□□□ -0.32
YTM1Q12024 POA1YBR022W 534 nt13□□□□□ -0.33
YTM1Q12024 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.94□□□□□ -0.34
YTM1Q12024 PST2YDR032C 597 nt12.89□□□□□ -0.35
YTM1Q12024 BSC6YOL137W 1494 nt12.79□□□□□ -0.36
YTM1Q12024 TIR1YER011W 765 nt12.74□□□□□ -0.37
YTM1Q12024 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
YTM1Q12024 YJR018WYJR018W 363 nt12.64□□□□□ -0.39
YTM1Q12024 BUD23YCR047C 828 nt12.6□□□□□ -0.39
YTM1Q12024 PTC2YER089C 1395 nt12.56□□□□□ -0.4
YTM1Q12024 SSA1YAL005C 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
YTM1Q12024 SPT5YML010W 3192 nt12.49□□□□□ -0.41
YTM1Q12024 NAB2YGL122C 1578 nt12.45□□□□□ -0.42
YTM1Q12024 RPP2BYDR382W 333 nt12.45□□□□□ -0.42
YTM1Q12024 YKL097CYKL097C 411 nt12.42□□□□□ -0.42
YTM1Q12024 SHU1YHL006C 453 nt12.36□□□□□ -0.43
YTM1Q12024 YJR120WYJR120W 351 nt12.36□□□□□ -0.43
YTM1Q12024 SRB2YHR041C 633 nt12.27□□□□□ -0.45
YTM1Q12024 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
YTM1Q12024 DAL1YIR027C 1383 nt12.23□□□□□ -0.45
YTM1Q12024 INM2YDR287W 879 nt12.22□□□□□ -0.45
YTM1Q12024 FPR4YLR449W 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
YTM1Q12024 SSA4YER103W 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
YTM1Q12024 YGR021WYGR021W 873 nt12.16□□□□□ -0.46
YTM1Q12024 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.16□□□□□ -0.46
YTM1Q12024 WWM1YFL010C 636 nt12.15□□□□□ -0.46
YTM1Q12024 BDH2YAL061W 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
YTM1Q12024 PHO4YFR034C 939 nt12.11□□□□□ -0.47
YTM1Q12024 YBL100CYBL100C 315 nt12.09□□□□□ -0.47
YTM1Q12024 MEP2YNL142W 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
YTM1Q12024 HOM6YJR139C 1080 nt12.05□□□□□ -0.48
YTM1Q12024 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.01□□□□□ -0.49
YTM1Q12024 YPS1YLR120C 1710 nt12□□□□□ -0.49
YTM1Q12024 LSM3YLR438C-A 270 nt12□□□□□ -0.49
YTM1Q12024 MNP1YGL068W 585 nt11.96□□□□□ -0.49
YTM1Q12024 FUN26YAL022C 1554 nt11.93□□□□□ -0.5
YTM1Q12024 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
YTM1Q12024 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 RKM5YLR137W 1104 nt11.88□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.87□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 YOR139CYOR139C 393 nt11.86□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 DCW1YKL046C 1350 nt11.85□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 NPL3YDR432W 1245 nt11.85□□□□□ -0.51
YTM1Q12024 YOL037CYOL037C 354 nt11.83□□□□□ -0.52
YTM1Q12024 ALF1YNL148C 765 nt11.82□□□□□ -0.52
YTM1Q12024 CCT6YDR188W 1641 nt11.8□□□□□ -0.52
YTM1Q12024 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.75□□□□□ -0.53
YTM1Q12024 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.75□□□□□ -0.53
YTM1Q12024 BDF1YLR399C 2061 nt11.74□□□□□ -0.53
YTM1Q12024 EMI2YDR516C 1503 nt11.69□□□□□ -0.54
YTM1Q12024 PTP1YDL230W 1008 nt11.65□□□□□ -0.54
YTM1Q12024 RPP2AYOL039W 321 nt11.64□□□□□ -0.55
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