RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C CSE1P33307 960 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MRPL3P36516 390 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MBA1P38300 278 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C KRE29P40026 464 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MND1P53102 219 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C LIF1P53150 421 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YPL113CQ02961 396 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YMR209CQ03648 457 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YDR222WQ04925 415 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YOR114WQ12219 294 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C IES3Q12345 250 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C FMP16Q12497 93 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RPS23BP0CX30 145 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C FRS2P15625 503 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PRE7P23724 241 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C AVT7P40501 490 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C UFD1P53044 361 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YML018CQ03730 393 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C GTO3Q04806 366 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TDH1P00360 332 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RPC40P07703 335 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YSR3P23501 404 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SUA5P32579 426 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PPQ1P32945 549 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ECM14P38836 430 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PEX18P38855 283 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SYS1P41544 203 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YFR045WP43617 309 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C GPI8P49018 411 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TPN1P53099 579 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MRS2Q01926 470 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C DXO1Q06349 442 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YPR063CQ12160 140 aa1.25□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PET494P07390 489 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MED8P38304 223 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SEN34P39707 275 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ECO1P43605 281 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C FMP33P46998 180 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C CPD1P53314 239 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C OSH6Q02201 448 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C CSI1Q04368 295 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TAF9Q05027 157 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C HRT1Q08273 121 aa1.24□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SSA3P09435 649 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YAK1P14680 807 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C DAL5P15365 543 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C OM45P16547 393 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PHO80P20052 293 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ATG15P25641 520 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C EBP2P36049 427 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YHL044WP38727 235 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C AVT6P40074 448 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MRX5P47007 382 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C COG7P53195 279 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PEX31P53203 462 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SPP2Q02521 185 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C VPS60Q03390 229 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C NNT1Q05874 261 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YDL144CQ07589 356 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C VPS1P21576 704 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C COT1P32798 439 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TKL2P33315 681 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RTT105P40063 208 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C IBA57P47158 497 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C LSB1P53281 241 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C VBA1Q04301 562 aa1.23□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RPS3P05750 240 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YOL163WP0CF20 169 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C OSM1P21375 501 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C KRE6P32486 720 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C POP8P38208 133 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MEP1P40260 492 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C CDC14Q00684 551 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SFH1Q06168 426 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C LOA1Q06508 300 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PRR2Q12310 699 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ATG5Q12380 294 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MRX4Q12467 430 aa1.22□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YMR316C-AI2HB70 103 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C POF1P25576 258 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CAT2P32796 670 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RIB7P33312 244 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MRPL37P36532 105 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ATG12P38316 186 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PHO89P38361 574 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPE1P46969 238 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YJL144WP47009 104 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C EMC2P47133 292 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TVP15Q03860 143 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YDR114CQ04597 100 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YLL007CQ07799 665 aa1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms