Protein–RNA interactions for Protein: Q12380

ATG5, Autophagy protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG5Q12380 NSR1YGR159C 1245 nt16.8■□□□□ 0.28
ATG5Q12380 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.58■□□□□ 0.24
ATG5Q12380 NOP1YDL014W 984 nt15.98■□□□□ 0.15
ATG5Q12380 MDJ1YFL016C 1536 nt15.22■□□□□ 0.03
ATG5Q12380 YKL036CYKL036C 393 nt14.46□□□□□ -0.09
ATG5Q12380 YJL027CYJL027C 417 nt14□□□□□ -0.17
ATG5Q12380 SRX1YKL086W 384 nt14□□□□□ -0.17
ATG5Q12380 Q0297Q0297 156 nt13.92□□□□□ -0.18
ATG5Q12380 DBP2YNL112W 1641 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG5Q12380 YCR051WYCR051W 669 nt13.21□□□□□ -0.29
ATG5Q12380 SSA3YBL075C 1950 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG5Q12380 YBR190WYBR190W 312 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG5Q12380 SCS3YGL126W 1143 nt13□□□□□ -0.33
ATG5Q12380 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG5Q12380 RTC3YHR087W 336 nt12.71□□□□□ -0.37
ATG5Q12380 CCC1YLR220W 969 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG5Q12380 YOL085CYOL085C 342 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG5Q12380 RPP1BYDL130W 321 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG5Q12380 RVS167YDR388W 1449 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG5Q12380 PKP1YIL042C 1185 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG5Q12380 SCJ1YMR214W 1134 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG5Q12380 PUT4YOR348C 1884 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG5Q12380 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG5Q12380 PET122YER153C 765 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG5Q12380 SHR5YOL110W 714 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG5Q12380 ARE1YCR048W 1833 nt11.83□□□□□ -0.51
ATG5Q12380 URN1YPR152C 1398 nt11.81□□□□□ -0.52
ATG5Q12380 OPI9YLR338W 858 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG5Q12380 SAH1YER043C 1350 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG5Q12380 POA1YBR022W 534 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG5Q12380 SCR1SCR1 522 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG5Q12380 DEP1YAL013W 1218 nt11.7□□□□□ -0.54
ATG5Q12380 YDJ1YNL064C 1230 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG5Q12380 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.65□□□□□ -0.54
ATG5Q12380 RRN5YLR141W 1092 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG5Q12380 RPN10YHR200W 807 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG5Q12380 BSC6YOL137W 1494 nt11.53□□□□□ -0.56
ATG5Q12380 ATS1YAL020C 1002 nt11.53□□□□□ -0.56
ATG5Q12380 YNL208WYNL208W 600 nt11.49□□□□□ -0.57
ATG5Q12380 GAR1YHR089C 618 nt11.43□□□□□ -0.58
ATG5Q12380 SPT5YML010W 3192 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG5Q12380 PUN1YLR414C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
ATG5Q12380 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG5Q12380 SSA4YER103W 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG5Q12380 BUD23YCR047C 828 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG5Q12380 PTC2YER089C 1395 nt11.28□□□□□ -0.6
ATG5Q12380 YJR018WYJR018W 363 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG5Q12380 RSB1YOR049C 1065 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG5Q12380 NAB2YGL122C 1578 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG5Q12380 TIR1YER011W 765 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG5Q12380 YJR120WYJR120W 351 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG5Q12380 FIS1YIL065C 468 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG5Q12380 SSA1YAL005C 1929 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG5Q12380 PAC11YDR488C 1602 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG5Q12380 BDF1YLR399C 2061 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG5Q12380 DAL1YIR027C 1383 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG5Q12380 RPP2BYDR382W 333 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG5Q12380 INM2YDR287W 879 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG5Q12380 PHO4YFR034C 939 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG5Q12380 FPR4YLR449W 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG5Q12380 MEP2YNL142W 1500 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG5Q12380 SRB2YHR041C 633 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG5Q12380 NVJ2YPR091C 2313 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG5Q12380 YPS1YLR120C 1710 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG5Q12380 TAT1YBR069C 1860 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG5Q12380 PST2YDR032C 597 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG5Q12380 YBL100CYBL100C 315 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG5Q12380 DCW1YKL046C 1350 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG5Q12380 YDR095CYDR095C 411 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG5Q12380 BDH2YAL061W 1254 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG5Q12380 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.66□□□□□ -0.7
ATG5Q12380 FUN26YAL022C 1554 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG5Q12380 EMI2YDR516C 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
ATG5Q12380 WWM1YFL010C 636 nt10.53□□□□□ -0.72
ATG5Q12380 PTP1YDL230W 1008 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 TRM9YML014W 840 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 ALF1YNL148C 765 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 YBR220CYBR220C 1683 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 LSM3YLR438C-A 270 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 RPP2AYOL039W 321 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG5Q12380 CAC2YML102W 1407 nt10.46□□□□□ -0.74
ATG5Q12380 CCT6YDR188W 1641 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG5Q12380 YDL221WYDL221W 552 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG5Q12380 YMR090WYMR090W 684 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG5Q12380 FPS1YLL043W 2010 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG5Q12380 SHU1YHL006C 453 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 SIS1YNL007C 1059 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 SDH1YKL148C 1923 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.37□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 YGR021WYGR021W 873 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms