Protein–RNA interactions for Protein: Q12160

YPR063C, Uncharacterized protein YPR063C, yeastyeast

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR063CQ12160 NSR1YGR159C 1245 nt15.52■□□□□ 0.08
YPR063CQ12160 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.48■□□□□ 0.07
YPR063CQ12160 NOP1YDL014W 984 nt15.08■□□□□ 0
YPR063CQ12160 MDJ1YFL016C 1536 nt14.28□□□□□ -0.12
YPR063CQ12160 SSA3YBL075C 1950 nt13.84□□□□□ -0.19
YPR063CQ12160 YKL036CYKL036C 393 nt13.7□□□□□ -0.22
YPR063CQ12160 SRX1YKL086W 384 nt13.08□□□□□ -0.32
YPR063CQ12160 YJL027CYJL027C 417 nt13.07□□□□□ -0.32
YPR063CQ12160 Q0297Q0297 156 nt13.03□□□□□ -0.32
YPR063CQ12160 YCR051WYCR051W 669 nt12.44□□□□□ -0.42
YPR063CQ12160 YBR190WYBR190W 312 nt12.41□□□□□ -0.42
YPR063CQ12160 SCS3YGL126W 1143 nt12.31□□□□□ -0.44
YPR063CQ12160 DBP2YNL112W 1641 nt12.15□□□□□ -0.46
YPR063CQ12160 RTC3YHR087W 336 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR063CQ12160 PUT4YOR348C 1884 nt12.05□□□□□ -0.48
YPR063CQ12160 SSA4YER103W 1929 nt11.91□□□□□ -0.5
YPR063CQ12160 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YPR063CQ12160 CCC1YLR220W 969 nt11.81□□□□□ -0.52
YPR063CQ12160 YOL085CYOL085C 342 nt11.81□□□□□ -0.52
YPR063CQ12160 RPP1BYDL130W 321 nt11.72□□□□□ -0.53
YPR063CQ12160 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.53
YPR063CQ12160 SPT5YML010W 3192 nt11.71□□□□□ -0.54
YPR063CQ12160 PKP1YIL042C 1185 nt11.63□□□□□ -0.55
YPR063CQ12160 POA1YBR022W 534 nt11.63□□□□□ -0.55
YPR063CQ12160 RVS167YDR388W 1449 nt11.6□□□□□ -0.55
YPR063CQ12160 BSC6YOL137W 1494 nt11.57□□□□□ -0.56
YPR063CQ12160 BDF1YLR399C 2061 nt11.51□□□□□ -0.57
YPR063CQ12160 ARE1YCR048W 1833 nt11.51□□□□□ -0.57
YPR063CQ12160 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.43□□□□□ -0.58
YPR063CQ12160 NVJ2YPR091C 2313 nt11.42□□□□□ -0.58
YPR063CQ12160 TAT1YBR069C 1860 nt11.35□□□□□ -0.59
YPR063CQ12160 SCJ1YMR214W 1134 nt11.27□□□□□ -0.61
YPR063CQ12160 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.21□□□□□ -0.61
YPR063CQ12160 SAH1YER043C 1350 nt11.2□□□□□ -0.62
YPR063CQ12160 PET122YER153C 765 nt11.16□□□□□ -0.62
YPR063CQ12160 SCR1SCR1 522 nt11.16□□□□□ -0.62
YPR063CQ12160 URN1YPR152C 1398 nt11.13□□□□□ -0.63
YPR063CQ12160 BUD23YCR047C 828 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR063CQ12160 SHR5YOL110W 714 nt11.06□□□□□ -0.64
YPR063CQ12160 FPS1YLL043W 2010 nt11.02□□□□□ -0.64
YPR063CQ12160 ATS1YAL020C 1002 nt10.98□□□□□ -0.65
YPR063CQ12160 OPI9YLR338W 858 nt10.98□□□□□ -0.65
YPR063CQ12160 MEP2YNL142W 1500 nt10.96□□□□□ -0.65
YPR063CQ12160 YDJ1YNL064C 1230 nt10.86□□□□□ -0.67
YPR063CQ12160 RRN5YLR141W 1092 nt10.84□□□□□ -0.67
YPR063CQ12160 DCW1YKL046C 1350 nt10.77□□□□□ -0.68
YPR063CQ12160 RPN10YHR200W 807 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR063CQ12160 DEP1YAL013W 1218 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR063CQ12160 YBR220CYBR220C 1683 nt10.74□□□□□ -0.69
YPR063CQ12160 PTC2YER089C 1395 nt10.72□□□□□ -0.69
YPR063CQ12160 NAB2YGL122C 1578 nt10.72□□□□□ -0.69
YPR063CQ12160 PUN1YLR414C 792 nt10.67□□□□□ -0.7
YPR063CQ12160 GAR1YHR089C 618 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 YNL208WYNL208W 600 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 PCH2YBR186W 1695 nt10.63□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 YMR090WYMR090W 684 nt10.63□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 RSB1YOR049C 1065 nt10.63□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 GUT2YIL155C 1950 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 EMI2YDR516C 1503 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR063CQ12160 UME6YDR207C 2511 nt10.54□□□□□ -0.72
YPR063CQ12160 SEC11YIR022W 504 nt10.52□□□□□ -0.73
YPR063CQ12160 SDH1YKL148C 1923 nt10.48□□□□□ -0.73
YPR063CQ12160 FIS1YIL065C 468 nt10.47□□□□□ -0.73
YPR063CQ12160 SSA1YAL005C 1929 nt10.46□□□□□ -0.73
YPR063CQ12160 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.45□□□□□ -0.74
YPR063CQ12160 YPS1YLR120C 1710 nt10.44□□□□□ -0.74
YPR063CQ12160 BOR1YNL275W 1731 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR063CQ12160 YDL221WYDL221W 552 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR063CQ12160 FPR4YLR449W 1179 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR063CQ12160 DAL1YIR027C 1383 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR063CQ12160 YJR018WYJR018W 363 nt10.38□□□□□ -0.75
YPR063CQ12160 PIB2YGL023C 1908 nt10.35□□□□□ -0.75
YPR063CQ12160 PHO4YFR034C 939 nt10.3□□□□□ -0.76
YPR063CQ12160 TIR1YER011W 765 nt10.29□□□□□ -0.76
YPR063CQ12160 RTF1YGL244W 1677 nt10.27□□□□□ -0.77
YPR063CQ12160 SCC4YER147C 1875 nt10.27□□□□□ -0.77
YPR063CQ12160 YDR095CYDR095C 411 nt10.21□□□□□ -0.77
YPR063CQ12160 MCH5YOR306C 1566 nt10.21□□□□□ -0.78
YPR063CQ12160 CAC2YML102W 1407 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR063CQ12160 YSC84YHR016C 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
YPR063CQ12160 RPP2BYDR382W 333 nt10.19□□□□□ -0.78
YPR063CQ12160 PST2YDR032C 597 nt10.16□□□□□ -0.78
YPR063CQ12160 INM2YDR287W 879 nt10.13□□□□□ -0.79
YPR063CQ12160 BOP3YNL042W 1191 nt10.11□□□□□ -0.79
YPR063CQ12160 PTK1YKL198C 1989 nt10.08□□□□□ -0.8
YPR063CQ12160 PTP1YDL230W 1008 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR063CQ12160 IRC15YPL017C 1500 nt10.05□□□□□ -0.8
YPR063CQ12160 YHL050CYHL050C 2094 nt10.05□□□□□ -0.8
YPR063CQ12160 RPP2AYOL039W 321 nt10.03□□□□□ -0.8
YPR063CQ12160 GIS3YLR094C 1509 nt10.02□□□□□ -0.81
YPR063CQ12160 YJR120WYJR120W 351 nt9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms