Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.8■□□□□ 0.44
AVT7P40501 NSR1YGR159C 1245 nt17.57■□□□□ 0.4
AVT7P40501 NOP1YDL014W 984 nt17.43■□□□□ 0.38
AVT7P40501 YKL036CYKL036C 393 nt16.21■□□□□ 0.19
AVT7P40501 MDJ1YFL016C 1536 nt15.92■□□□□ 0.14
AVT7P40501 Q0297Q0297 156 nt15.26■□□□□ 0.03
AVT7P40501 SRX1YKL086W 384 nt15.18■□□□□ 0.02
AVT7P40501 YJL027CYJL027C 417 nt15.17■□□□□ 0.02
AVT7P40501 SCS3YGL126W 1143 nt14.8□□□□□ -0.04
AVT7P40501 YCR051WYCR051W 669 nt14.43□□□□□ -0.1
AVT7P40501 YOL085CYOL085C 342 nt14□□□□□ -0.17
AVT7P40501 DBP2YNL112W 1641 nt13.93□□□□□ -0.18
AVT7P40501 PKP1YIL042C 1185 nt13.75□□□□□ -0.21
AVT7P40501 YBR190WYBR190W 312 nt13.71□□□□□ -0.21
AVT7P40501 RPP1BYDL130W 321 nt13.69□□□□□ -0.22
AVT7P40501 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
AVT7P40501 CCC1YLR220W 969 nt13.48□□□□□ -0.25
AVT7P40501 SCJ1YMR214W 1134 nt13.38□□□□□ -0.27
AVT7P40501 RTC3YHR087W 336 nt13.37□□□□□ -0.27
AVT7P40501 ATS1YAL020C 1002 nt13.29□□□□□ -0.28
AVT7P40501 RVS167YDR388W 1449 nt13.06□□□□□ -0.32
AVT7P40501 PET122YER153C 765 nt13.04□□□□□ -0.32
AVT7P40501 SCR1SCR1 522 nt13.02□□□□□ -0.33
AVT7P40501 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.94□□□□□ -0.34
AVT7P40501 SSA3YBL075C 1950 nt12.91□□□□□ -0.34
AVT7P40501 PUT4YOR348C 1884 nt12.7□□□□□ -0.38
AVT7P40501 RRN5YLR141W 1092 nt12.69□□□□□ -0.38
AVT7P40501 SHR5YOL110W 714 nt12.54□□□□□ -0.4
AVT7P40501 YDJ1YNL064C 1230 nt12.53□□□□□ -0.4
AVT7P40501 RSB1YOR049C 1065 nt12.52□□□□□ -0.41
AVT7P40501 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.43□□□□□ -0.42
AVT7P40501 URN1YPR152C 1398 nt12.38□□□□□ -0.43
AVT7P40501 ARE1YCR048W 1833 nt12.35□□□□□ -0.43
AVT7P40501 OPI9YLR338W 858 nt12.28□□□□□ -0.44
AVT7P40501 POA1YBR022W 534 nt12.28□□□□□ -0.44
AVT7P40501 SAH1YER043C 1350 nt12.28□□□□□ -0.44
AVT7P40501 PST2YDR032C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
AVT7P40501 DEP1YAL013W 1218 nt12.25□□□□□ -0.45
AVT7P40501 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.22□□□□□ -0.45
AVT7P40501 GAR1YHR089C 618 nt12.21□□□□□ -0.45
AVT7P40501 RPN10YHR200W 807 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT7P40501 BSC6YOL137W 1494 nt12.09□□□□□ -0.47
AVT7P40501 YNL208WYNL208W 600 nt12.04□□□□□ -0.48
AVT7P40501 PUN1YLR414C 792 nt11.94□□□□□ -0.5
AVT7P40501 YKL097CYKL097C 411 nt11.92□□□□□ -0.5
AVT7P40501 BUD23YCR047C 828 nt11.91□□□□□ -0.5
AVT7P40501 PTC2YER089C 1395 nt11.83□□□□□ -0.52
AVT7P40501 YJR018WYJR018W 363 nt11.8□□□□□ -0.52
AVT7P40501 TIR1YER011W 765 nt11.79□□□□□ -0.52
AVT7P40501 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
AVT7P40501 SPT5YML010W 3192 nt11.75□□□□□ -0.53
AVT7P40501 SHU1YHL006C 453 nt11.71□□□□□ -0.53
AVT7P40501 SSA1YAL005C 1929 nt11.56□□□□□ -0.56
AVT7P40501 SSA4YER103W 1929 nt11.54□□□□□ -0.56
AVT7P40501 FIS1YIL065C 468 nt11.51□□□□□ -0.57
AVT7P40501 DAL1YIR027C 1383 nt11.51□□□□□ -0.57
AVT7P40501 YJR120WYJR120W 351 nt11.5□□□□□ -0.57
AVT7P40501 RPP2BYDR382W 333 nt11.47□□□□□ -0.57
AVT7P40501 FPR4YLR449W 1179 nt11.47□□□□□ -0.57
AVT7P40501 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.46□□□□□ -0.57
AVT7P40501 INM2YDR287W 879 nt11.44□□□□□ -0.58
AVT7P40501 MEP2YNL142W 1500 nt11.4□□□□□ -0.59
AVT7P40501 PHO4YFR034C 939 nt11.39□□□□□ -0.59
AVT7P40501 SRB2YHR041C 633 nt11.36□□□□□ -0.59
AVT7P40501 YGR021WYGR021W 873 nt11.34□□□□□ -0.59
AVT7P40501 YOR139CYOR139C 393 nt11.34□□□□□ -0.59
AVT7P40501 YPS1YLR120C 1710 nt11.31□□□□□ -0.6
AVT7P40501 NPL3YDR432W 1245 nt11.29□□□□□ -0.6
AVT7P40501 WWM1YFL010C 636 nt11.28□□□□□ -0.6
AVT7P40501 HOM6YJR139C 1080 nt11.26□□□□□ -0.61
AVT7P40501 YBL100CYBL100C 315 nt11.25□□□□□ -0.61
AVT7P40501 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.22□□□□□ -0.61
AVT7P40501 MNP1YGL068W 585 nt11.21□□□□□ -0.61
AVT7P40501 DCW1YKL046C 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
AVT7P40501 YDR095CYDR095C 411 nt11.19□□□□□ -0.62
AVT7P40501 BDH2YAL061W 1254 nt11.17□□□□□ -0.62
AVT7P40501 YOL037CYOL037C 354 nt11.16□□□□□ -0.62
AVT7P40501 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.14□□□□□ -0.63
AVT7P40501 BDF1YLR399C 2061 nt11.11□□□□□ -0.63
AVT7P40501 RKM5YLR137W 1104 nt11.1□□□□□ -0.63
AVT7P40501 FUN26YAL022C 1554 nt11.1□□□□□ -0.63
AVT7P40501 EMI2YDR516C 1503 nt11.06□□□□□ -0.64
AVT7P40501 YMR090WYMR090W 684 nt11.05□□□□□ -0.64
AVT7P40501 LSM3YLR438C-A 270 nt11.04□□□□□ -0.64
AVT7P40501 ALF1YNL148C 765 nt11.04□□□□□ -0.64
AVT7P40501 TRM9YML014W 840 nt11.03□□□□□ -0.64
AVT7P40501 RPP2AYOL039W 321 nt10.98□□□□□ -0.65
AVT7P40501 TAT1YBR069C 1860 nt10.97□□□□□ -0.65
AVT7P40501 YBR220CYBR220C 1683 nt10.95□□□□□ -0.66
AVT7P40501 PTP1YDL230W 1008 nt10.95□□□□□ -0.66
AVT7P40501 YDL221WYDL221W 552 nt10.94□□□□□ -0.66
AVT7P40501 CAC2YML102W 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
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