RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	STE18	P18852	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NUP1	P20676	1076 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DIT1	P21623	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SCO1	P23833	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CNE1	P27825	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	THI4	P32318	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MKS1	P34072	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SEF1	P34228	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	LST4	P34239	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SFK1	P35735	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	GPX1	P36014	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MLH1	P38920	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SYG1	P40528	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SHR5	P41912	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPE1	P46969	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MDE1	P47095	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YJR098C	P47139	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGR042W	P53227	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PET191	Q02772	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TPP1	Q03796	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	GIS1	Q03833	894 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PLP1	Q04004	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	KEI1	Q06346	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TMS1	Q12116	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	HMS1	Q12398	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	QCR7	P00128	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PMT2	P31382	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPC34	P32910	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MSN4	P33749	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	COS9	P36034	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YJL193W	P39542	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YER184C	P39961	794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGL204C	P53089	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	ATG21	Q02887	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BNA7	Q04066	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YRM1	Q12340	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SWM1	Q12379	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	COX1	P00401	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PPG1	P32838	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SLC1	P33333	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TAF14	P35189	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	FAA3	P39002	694 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	OTU1	P43558	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CIN2	P46670	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	LYS5	P50113	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	VHT1	P53241	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGR066C	P53242	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGR126W	P53274	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CUZ1	P53899	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RSM28	Q03430	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SCS7	Q03529	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DLT1	Q04216	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRX8	Q05473	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PIN2	Q12057	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BAG7	Q12128	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BBP1	Q12365	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	ORT1	Q12375	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	STE50	P25344	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	AGA2	P32781	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	APD1	P38281	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	OM14	P38325	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	RTT105	P40063	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	YIL067C	P40514	678 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	TIR3	P40552	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	BUD8	P41698	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	CUP9	P41817	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	CCC1	P47818	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	TYW3	P53177	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	PEX25	Q02969	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	VBA1	Q04301	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	DFG5	Q05031	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	PEX30	Q06169	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL21B	YPL079W	FMP16	Q12497	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.4 ms