RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RIB1	P38066	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YER186C	P40101	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MAL13	P53338	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	LAG2	Q92325	660 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YBL059W	P34224	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	VAB2	P40003	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YJR012C	P47087	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YJR054W	P47114	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PER33	Q12144	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YBR241C	P38142	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MIC12	P38341	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	VEL1	P53058	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TFC7	Q12415	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SRB8	P25648	1427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	QRI5	P32344	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YPS5	P53057	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	IRC25	Q07951	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	GET4	Q12125	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SEY1	Q99287	776 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	IFM1	P25038	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	GPX1	P36014	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	KRE9	P39005	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YGR015C	P53208	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TAF9	Q05027	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	BUD4	P47136	1447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	STE7	P06784	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	AEP1	P32493	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SHC1	P39000	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SER33	P40510	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	DSN1	P40568	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	ZRG17	P53735	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YNR066C	P53752	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	NAM9	P27929	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	SHE1	P38200	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	OXA1	P39952	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	ERG28	P40030	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YJR079W	P47126	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YNL095C	P53932	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	SWS2	P53937	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	LOA1	Q06508	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	NDD1	Q08887	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	NCB2	Q92317	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YPK2	P18961	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	SDS23	P53172	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	ADD37	Q03233	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YML018C	Q03730	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	SEC10	Q06245	871 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MYO4	P32492	1471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	PDR10	P51533	1564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	STE18	P18852	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	BMT2	P38278	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YRB2	P40517	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	NBP35	P52920	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	NRM1	P53718	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YET2	Q04210	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YMR31	P19955	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YCR102C	P25608	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	EHD3	P28817	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	TIM17	P39515	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	USE1	P53146	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.9 ms