RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	CHK1	P38147	527 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ALG3	P38179	458 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	IFA38	P38286	347 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	FET3	P38993	636 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PMT6	P42934	759 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MDV1	P47025	714 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YJR120W	P47157	116 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PMT5	P52867	743 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	DOC1	P53068	250 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TDA1	Q03533	586 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RSC58	Q07979	502 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YPL199C	Q08954	240 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SOD2	P00447	233 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	NUP1	P20676	1076 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ERG9	P29704	444 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RNP1	P32385	249 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.52	□□□□□ -1.53	not detected
YCK1	YHR135C	MTH1	P35198	433 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.52	□□□□□ -1.53	not detected
YCK1	YHR135C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PEX32	P38292	413 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HPA3	P39979	161 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SHR5	P41912	237 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	BRR6	P53062	197 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TPO3	Q06451	622 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRL1	Q06815	381 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ASR1	Q06834	288 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	AIM6	Q07716	390 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MCP1	Q12106	302 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RLM1	Q12224	676 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SFG1	Q12507	346 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	BLM10	P43583	2143 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	GCN4	P03069	281 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HIS3	P06633	220 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ATG22	P25568	528 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PMT2	P31382	759 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HYM1	P32464	399 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	DOA4	P32571	926 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TRS65	P32893	560 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	GPX1	P36014	167 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	VMA22	P38784	181 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YJL193W	P39542	402 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SIT1	P39980	628 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TPN1	P53099	579 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRPL22	P53881	309 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ASI3	P53983	676 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PHO92	Q06390	306 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	COQ10	Q08058	207 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HMG1	P12683	1054 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	STE12	P13574	688 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YCR102C	P25608	368 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PRE4	P30657	266 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	VPS17	P32913	551 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SEF1	P34228	1148 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CLG1	P35190	452 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MSS4	P38994	779 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	LCL3	P53153	274 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SNX41	Q04053	625 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YOR352W	Q08816	343 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ENV7	Q12003	364 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HSP42	Q12329	375 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SET6	Q12529	373 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PPA2	P28239	310 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PAU2	P32612	120 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PPQ1	P32945	549 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SLC1	P33333	303 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	TRS23	Q03784	219 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	FRE7	Q12333	620 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SCM3	Q12334	223 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YOR343C	Q12484	108 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	COX1	P00401	534 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	OPI3	P05375	206 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	DAL82	P21705	255 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PDR3	P33200	976 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MSN4	P33749	630 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YHR122W	P38829	231 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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