RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	PUT2	P07275	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MAK32	P23060	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YCR006C	P25350	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	UBC8	P28263	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MBB1	P39534	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RBG1	P39729	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PCL7	P40186	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PMT4	P46971	762 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YJL043W	P47053	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	ECM27	P47144	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	BIO3	P50277	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YNR068C	P53754	272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YML096W	Q04489	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	GET4	Q12125	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VAM3	Q12241	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	COR1	P07256	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	CLB2	P24869	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	CTR86	P25355	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SPC34	P36131	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RIB1	P38066	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RCK1	P38622	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	GGC1	P38988	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YJL070C	P40361	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YRB2	P40517	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	BIR1	P47134	954 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	TOM22	P49334	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MGR3	Q04472	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	DCS1	Q06151	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VPS74	Q06385	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	ARR1	Q06596	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MFG1	Q07684	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YPR096C	O13587	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YMC1	P32331	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VPH2	P32341	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	HIR2	P32480	875 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SPO23	P33757	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YBR285W	P38354	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YEL020C	P39994	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PDR8	Q06149	701 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	ATG17	Q06410	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	NDL1	Q06568	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	THP1	Q08231	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PFA4	Q12006	378 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
RPL3	YOR063W	HER1	Q12276	1246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	STT4	P37297	1900 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	GAL3	P13045	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	CNA1	P23287	553 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MEI5	P32489	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	KKQ8	P36004	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MRPL4	P36517	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MET30	P39014	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VHS2	P40463	436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	APQ12	P40532	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SHE4	P51534	789 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	GOR1	P53839	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SMP3	Q04174	516 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	SWF1	Q04629	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	PLB3	Q08108	686 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MCH4	Q08268	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	RSA1	Q08932	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	VIK1	Q12045	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	FRE7	Q12333	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL3	YOR063W	MTR10	Q99189	972 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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