RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	MNE1	P24720	663 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	BRF1	P29056	596 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YEL043W	P32618	956 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	TFB1	P32776	642 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SRX1	P36077	127 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RRN10	P38204	145 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	TAE1	P38340	232 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	PFS1	P38872	237 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	PGU1	P47180	361 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	COQ5	P49017	307 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	NBP35	P52920	328 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	COG7	P53195	279 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	OCA2	P53949	197 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CDC14	Q00684	551 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LDB18	Q07887	179 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.58	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RAD1	P06777	1100 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CIN8	P27895	1000 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SMI1	P32566	505 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SMF2	P38778	549 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	COX14	P39103	70 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SIM1	P40472	476 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	MIC19	P43594	170 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	ATG18	P43601	500 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LCB3	P47013	409 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YNL143C	P53908	130 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YET2	Q04210	160 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YMR130W	Q04223	302 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	ATG10	Q07879	167 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	ATG34	Q12292	412 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LDB17	Q12342	491 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YOR338W	Q99326	363 aa		2.57	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
PEX18	YHR160C	RPB5	P20434	215 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RPO26	P20435	155 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	URA10	P30402	227 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CSE1	P33307	960 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LDB7	P38210	180 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YHI9	P38765	294 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	TOM22	P49334	152 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	MST27	P53176	234 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SWC4	P53201	476 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YGR018C	P53211	109 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SLT2	Q00772	484 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	PET117	Q02771	107 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YPL113C	Q02961	396 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	VPS60	Q03390	229 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	DCS1	Q06151	350 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	UAF30	Q08747	228 aa		2.56	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CDC8	P00572	216 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YCR099C	P25657	155 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	IML3	P38265	245 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	INA22	P40576	216 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YPS6	P40583	537 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	OSH6	Q02201	448 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	HOT1	Q03213	719 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	TDA1	Q03533	586 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CDC123	Q05791	360 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	MDM36	Q06820	579 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SRO7	Q12038	1033 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	IRA1	P18963	3092 aa		2.55	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CAP2	P13517	287 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YSR3	P23501	404 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	PEX5	P35056	612 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	ETR1	P38071	380 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	MRPS9	P38120	278 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YSW1	P38280	609 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	OM14	P38325	134 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YHK8	P38776	514 aa		2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PEX18	YHR160C	CYC2	P38909	366 aa		2.54	□□□□□ -2

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