Protein–RNA interactions for Protein: P43601

ATG18, Autophagy-related protein 18, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG18P43601 NSR1YGR159C 1245 nt17.94■□□□□ 0.46
ATG18P43601 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.59■□□□□ 0.41
ATG18P43601 NOP1YDL014W 984 nt16.92■□□□□ 0.3
ATG18P43601 MDJ1YFL016C 1536 nt16.42■□□□□ 0.22
ATG18P43601 YJL027CYJL027C 417 nt15.11■□□□□ 0.01
ATG18P43601 YKL036CYKL036C 393 nt15.09■□□□□ 0.01
ATG18P43601 SRX1YKL086W 384 nt14.76□□□□□ -0.05
ATG18P43601 Q0297Q0297 156 nt14.63□□□□□ -0.07
ATG18P43601 DBP2YNL112W 1641 nt14.32□□□□□ -0.12
ATG18P43601 YBR190WYBR190W 312 nt14.16□□□□□ -0.14
ATG18P43601 YCR051WYCR051W 669 nt13.93□□□□□ -0.18
ATG18P43601 RTC3YHR087W 336 nt13.79□□□□□ -0.2
ATG18P43601 SSA3YBL075C 1950 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG18P43601 CCC1YLR220W 969 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG18P43601 SCS3YGL126W 1143 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG18P43601 RVS167YDR388W 1449 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG18P43601 PUT4YOR348C 1884 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG18P43601 SCJ1YMR214W 1134 nt13.18□□□□□ -0.3
ATG18P43601 RPP1BYDL130W 321 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG18P43601 YOL085CYOL085C 342 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG18P43601 PKP1YIL042C 1185 nt12.91□□□□□ -0.34
ATG18P43601 ARE1YCR048W 1833 nt12.86□□□□□ -0.35
ATG18P43601 SHR5YOL110W 714 nt12.78□□□□□ -0.36
ATG18P43601 POA1YBR022W 534 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG18P43601 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG18P43601 URN1YPR152C 1398 nt12.72□□□□□ -0.37
ATG18P43601 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG18P43601 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG18P43601 OPI9YLR338W 858 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG18P43601 BSC6YOL137W 1494 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG18P43601 PET122YER153C 765 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG18P43601 DEP1YAL013W 1218 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG18P43601 SPT5YML010W 3192 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG18P43601 RPN10YHR200W 807 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG18P43601 YDJ1YNL064C 1230 nt12.35□□□□□ -0.43
ATG18P43601 YNL208WYNL208W 600 nt12.34□□□□□ -0.43
ATG18P43601 BUD23YCR047C 828 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG18P43601 SCR1SCR1 522 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG18P43601 PUN1YLR414C 792 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG18P43601 SSA4YER103W 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG18P43601 PTC2YER089C 1395 nt12.21□□□□□ -0.45
ATG18P43601 NAB2YGL122C 1578 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG18P43601 RRN5YLR141W 1092 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG18P43601 GAR1YHR089C 618 nt12.12□□□□□ -0.47
ATG18P43601 YJR018WYJR018W 363 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG18P43601 FIS1YIL065C 468 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG18P43601 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.92□□□□□ -0.5
ATG18P43601 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG18P43601 DAL1YIR027C 1383 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG18P43601 ATS1YAL020C 1002 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG18P43601 BDF1YLR399C 2061 nt11.84□□□□□ -0.51
ATG18P43601 FPR4YLR449W 1179 nt11.82□□□□□ -0.52
ATG18P43601 YJR120WYJR120W 351 nt11.81□□□□□ -0.52
ATG18P43601 PHO4YFR034C 939 nt11.79□□□□□ -0.52
ATG18P43601 INM2YDR287W 879 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG18P43601 TIR1YER011W 765 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG18P43601 RSB1YOR049C 1065 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG18P43601 RPP2BYDR382W 333 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG18P43601 YPS1YLR120C 1710 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG18P43601 SSA1YAL005C 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG18P43601 TAT1YBR069C 1860 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG18P43601 DCW1YKL046C 1350 nt11.68□□□□□ -0.54
ATG18P43601 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.63□□□□□ -0.55
ATG18P43601 YDR095CYDR095C 411 nt11.59□□□□□ -0.55
ATG18P43601 YBL100CYBL100C 315 nt11.56□□□□□ -0.56
ATG18P43601 EMI2YDR516C 1503 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG18P43601 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
ATG18P43601 YBR220CYBR220C 1683 nt11.5□□□□□ -0.57
ATG18P43601 YDL221WYDL221W 552 nt11.43□□□□□ -0.58
ATG18P43601 BDH2YAL061W 1254 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG18P43601 FUN26YAL022C 1554 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG18P43601 SRB2YHR041C 633 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG18P43601 SDH1YKL148C 1923 nt11.38□□□□□ -0.59
ATG18P43601 PTP1YDL230W 1008 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG18P43601 ALF1YNL148C 765 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG18P43601 RPP2AYOL039W 321 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG18P43601 CAC2YML102W 1407 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG18P43601 TRM9YML014W 840 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG18P43601 PAC11YDR488C 1602 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG18P43601 SCC4YER147C 1875 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG18P43601 CCT6YDR188W 1641 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG18P43601 PCH2YBR186W 1695 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG18P43601 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG18P43601 IRC15YPL017C 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG18P43601 SIS1YNL007C 1059 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG18P43601 LSM3YLR438C-A 270 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG18P43601 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG18P43601 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG18P43601 GUT2YIL155C 1950 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG18P43601 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
ATG18P43601 WWM1YFL010C 636 nt11.13□□□□□ -0.63
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