RNA–Protein interactions for RNA: YPL058C

PDR12, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeastyeast

Gene PDR12, Length 4,536 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12YPL058C CCZ1P38273 704 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CSN9Q03981 162 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YMR254CQ04838 102 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MCM21Q06675 368 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C IRC23Q08416 157 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MCP1Q12106 302 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RAX2Q12465 1220 aa3.52□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ATS1P31386 333 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ROT2P38138 954 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YBR241CP38142 488 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YIL029CP40538 142 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YGR201CP42936 225 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C PRM10P42946 383 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C COG2P53271 262 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YDC1Q02896 317 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C GPI18P38211 433 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C GCD10P41814 478 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YNL320WP42840 284 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ERV29P53337 310 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YAP6Q03935 383 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RIM9Q04734 239 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CCH1P50077 2039 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YJL213WP40896 331 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ATG4P53867 494 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C NCE101Q02820 53 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MDM36Q06820 579 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C UBX3Q12229 455 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RTN2Q12443 393 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C TOP3P13099 656 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MTC2P34246 357 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CTF8P38877 133 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C AIM46P38885 310 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MNN9P39107 395 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RSM27P53305 110 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SNF12P53628 566 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C EKI1Q03764 534 aa3.51□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YML119WQ03208 357 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C VTI1Q04338 217 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C TPO3Q06451 622 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C IPK1Q06667 281 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C APL4Q12028 832 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MSH5Q12175 901 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C AVL9Q12500 764 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YER190C-BP0CX94 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YFL068WP0CX99 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YLL066W-AP0CY00 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YLL067W-AP0CY01 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SPO12P17123 173 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CMK2P22517 447 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C IME2P32581 645 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C END3P39013 349 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C PIC2P40035 300 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MEP2P41948 499 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C UGO1Q03327 502 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C VPS74Q06385 345 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RIF1P29539 1916 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C ACP1P32463 125 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
PDR12YPL058C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C LOH1P47055 219 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C PGU1P47180 361 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YIP5P53108 310 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C REX2P54964 269 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RMI1Q02685 241 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SPO19Q03029 223 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C COQ10Q08058 207 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C RMP1Q12530 201 aa3.5□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YCR100CP25606 316 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YKR015CP36111 568 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C APL3P38065 1025 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YNR040WP53736 256 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SNO4Q04902 237 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SOR2Q07786 357 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C PRM3Q08931 133 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C HSP32Q08992 237 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C SEC12P11655 471 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C YAK1P14680 807 aa3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDR12YPL058C TRX3P25372 127 aa3.49□□□□□ -1.85
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